RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.84■■□□□ 1.89
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C4orf48-201ENST00000409248 SETDB2Q96T68 719 aa26.84■■□□□ 1.89
C4orf48-201ENST00000409248 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.84■■□□□ 1.89
C4orf48-201ENST00000409248 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.84■■□□□ 1.89
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C4orf48-201ENST00000409248 NUP98P52948 1817 aa26.83■■□□□ 1.89
C4orf48-201ENST00000409248 TGFB2P61812 414 aa26.83■■□□□ 1.89
C4orf48-201ENST00000409248 PDIA6Q15084 440 aa26.83■■□□□ 1.89
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C4orf48-201ENST00000409248 GPR162Q16538 588 aa26.82■■□□□ 1.88
C4orf48-201ENST00000409248 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.82■■□□□ 1.88
C4orf48-201ENST00000409248 PROSER3Q2NL68 480 aa26.81■■□□□ 1.88
C4orf48-201ENST00000409248 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.81■■□□□ 1.88
C4orf48-201ENST00000409248 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.81■■□□□ 1.88
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C4orf48-201ENST00000409248 E9PSI1 815 aa26.8■■□□□ 1.88
C4orf48-201ENST00000409248 ANXA1P04083 346 aa26.8■■□□□ 1.88
C4orf48-201ENST00000409248 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.8■■□□□ 1.88
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C4orf48-201ENST00000409248 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.79■■□□□ 1.88
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C4orf48-201ENST00000409248 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.78■■□□□ 1.88
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C4orf48-201ENST00000409248 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
C4orf48-201ENST00000409248 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.77■■□□□ 1.88
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C4orf48-201ENST00000409248 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
C4orf48-201ENST00000409248 HYPKQ9NX55 129 aa26.77■■□□□ 1.88
C4orf48-201ENST00000409248 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
C4orf48-201ENST00000409248 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.76■■□□□ 1.87
C4orf48-201ENST00000409248 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.76■■□□□ 1.87
C4orf48-201ENST00000409248 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.75■■□□□ 1.87
C4orf48-201ENST00000409248 ST5P78524 1137 aa26.75■■□□□ 1.87
C4orf48-201ENST00000409248 SLFN5Q08AF3 891 aa26.75■■□□□ 1.87
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.75■■□□□ 1.87
C4orf48-201ENST00000409248 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.75■■□□□ 1.87
C4orf48-201ENST00000409248 COPS6Q7L5N1 327 aa26.75■■□□□ 1.87
C4orf48-201ENST00000409248 A0A0G2JLW4 131 aa26.74■■□□□ 1.87
C4orf48-201ENST00000409248 DPEP1P16444 411 aa26.74■■□□□ 1.87
C4orf48-201ENST00000409248 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
C4orf48-201ENST00000409248 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
C4orf48-201ENST00000409248 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.74■■□□□ 1.87
C4orf48-201ENST00000409248 GRIN3BO60391 1043 aa26.73■■□□□ 1.87
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C4orf48-201ENST00000409248 TSPYL6Q8N831 410 aa26.73■■□□□ 1.87
C4orf48-201ENST00000409248 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
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C4orf48-201ENST00000409248 CHD4Q14839 1912 aa26.71■■□□□ 1.87
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C4orf48-201ENST00000409248 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.71■■□□□ 1.87
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C4orf48-201ENST00000409248 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.71■■□□□ 1.87
C4orf48-201ENST00000409248 PDE6BP35913 854 aa26.7■■□□□ 1.86
C4orf48-201ENST00000409248 STK31Q9BXU1 1019 aa26.7■■□□□ 1.86
C4orf48-201ENST00000409248 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.7■■□□□ 1.86
C4orf48-201ENST00000409248 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.69■■□□□ 1.86
C4orf48-201ENST00000409248 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
C4orf48-201ENST00000409248 PIM2Q9P1W9 311 aa26.69■■□□□ 1.86
C4orf48-201ENST00000409248 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.69■■□□□ 1.86
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C4orf48-201ENST00000409248 CHRNA5P30532 468 aa26.68■■□□□ 1.86
C4orf48-201ENST00000409248 PARP10Q53GL7 1025 aa26.68■■□□□ 1.86
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.68■■□□□ 1.86
C4orf48-201ENST00000409248 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.68■■□□□ 1.86
C4orf48-201ENST00000409248 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.67■■□□□ 1.86
C4orf48-201ENST00000409248 H0YIN7 160 aa26.67■■□□□ 1.86
C4orf48-201ENST00000409248 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
C4orf48-201ENST00000409248 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.67■■□□□ 1.86
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C4orf48-201ENST00000409248 KCNA3P22001 575 aa26.66■■□□□ 1.86
C4orf48-201ENST00000409248 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
C4orf48-201ENST00000409248 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.66■■□□□ 1.86
C4orf48-201ENST00000409248 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
C4orf48-201ENST00000409248 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.65■■□□□ 1.86
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.65■■□□□ 1.86
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C4orf48-201ENST00000409248 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.64■■□□□ 1.85
C4orf48-201ENST00000409248 TCIRG1Q13488 830 aa26.63■■□□□ 1.85
C4orf48-201ENST00000409248 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.63■■□□□ 1.85
C4orf48-201ENST00000409248 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
C4orf48-201ENST00000409248 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
C4orf48-201ENST00000409248 ABCC12Q96J65 1359 aa26.61■■□□□ 1.85
C4orf48-201ENST00000409248 SUSD4Q5VX71 490 aa26.61■■□□□ 1.85
C4orf48-201ENST00000409248 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.61■■□□□ 1.85
C4orf48-201ENST00000409248 VAMP4O75379 141 aa26.6■■□□□ 1.85
C4orf48-201ENST00000409248 NTSR2O95665 410 aa26.6■■□□□ 1.85
C4orf48-201ENST00000409248 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
C4orf48-201ENST00000409248 NLRP10Q86W26 655 aa26.59■■□□□ 1.85
C4orf48-201ENST00000409248 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.59■■□□□ 1.85
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