RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
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ANKRD54-203ENST00000407117 CCDC24Q8N4L8 307 aa36.45■■■■□ 3.43
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ANKRD54-203ENST00000407117 RNF181Q9P0P0 153 aa36.44■■■■□ 3.42
ANKRD54-203ENST00000407117 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP36.44■■■■□ 3.42
ANKRD54-203ENST00000407117 ERVV-1B6SEH8 477 aa36.42■■■■□ 3.42
ANKRD54-203ENST00000407117 TPTE2Q6XPS3 522 aa36.42■■■■□ 3.42
ANKRD54-203ENST00000407117 ADAMTS8Q9UP79 889 aa36.42■■■■□ 3.42
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ANKRD54-203ENST00000407117 STYK1Q6J9G0 422 aa36.4■■■■□ 3.42
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ANKRD54-203ENST00000407117 CNKSR1Q969H4 720 aa36.39■■■■□ 3.42
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ANKRD54-203ENST00000407117 TRIM35Q9UPQ4 493 aa36.35■■■■□ 3.41
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ANKRD54-203ENST00000407117 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
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ANKRD54-203ENST00000407117 PROSER3Q2NL68 480 aa36.21■■■■□ 3.39
ANKRD54-203ENST00000407117 RIC1Q4ADV7 1423 aa36.21■■■■□ 3.39
ANKRD54-203ENST00000407117 PARP10Q53GL7 1025 aa36.2■■■■□ 3.39
ANKRD54-203ENST00000407117 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
ANKRD54-203ENST00000407117 C7orf43Q8WVR3 580 aa36.2■■■■□ 3.39
ANKRD54-203ENST00000407117 ABCC12Q96J65 1359 aa36.19■■■■□ 3.38
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ANKRD54-203ENST00000407117 ALDH1B1P30837 517 aa36.19■■■■□ 3.38
ANKRD54-203ENST00000407117 CRY2Q49AN0 593 aa36.19■■■■□ 3.38
ANKRD54-203ENST00000407117 NUTM1Q86Y26 1132 aa36.19■■■■□ 3.38
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ANKRD54-203ENST00000407117 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa36.17■■■■□ 3.38
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ANKRD54-203ENST00000407117 TIAM2Q8IVF5 1701 aa36.17■■■■□ 3.38
ANKRD54-203ENST00000407117 NECTIN2Q92692 538 aa36.16■■■■□ 3.38
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ANKRD54-203ENST00000407117 CEP350Q5VT06 3117 aa36.14■■■■□ 3.38
ANKRD54-203ENST00000407117 NTSR2O95665 410 aa36.14■■■■□ 3.38
ANKRD54-203ENST00000407117 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa36.14■■■■□ 3.38
ANKRD54-203ENST00000407117 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa36.14■■■■□ 3.38
ANKRD54-203ENST00000407117 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa36.13■■■■□ 3.37
ANKRD54-203ENST00000407117 DPY19L2Q6NUT2 758 aa36.13■■■■□ 3.37
ANKRD54-203ENST00000407117 XAGE3Q8WTP9 111 aa36.13■■■■□ 3.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF853P0CG23 659 aa36.12■■■■□ 3.37
ANKRD54-203ENST00000407117 IFT57Q9NWB7 429 aa36.12■■■■□ 3.37
ANKRD54-203ENST00000407117 RNF123Q5XPI4 1314 aa36.11■■■■□ 3.37
ANKRD54-203ENST00000407117 RTKN2Q8IZC4 609 aa36.11■■■■□ 3.37
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