RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 PROSER3Q2NL68 480 aa21.38■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.38■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 MRS2Q9HD23 443 aa21.37■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.36■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.36■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 MBIPQ9NS73 344 aa21.36■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 CACNA1SQ13698 1873 aa21.36■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC27Q2M243 656 aa21.35■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 SETDB2Q96T68 719 aa21.35■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 IFT57Q9NWB7 429 aa21.35■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 PIM2Q9P1W9 311 aa21.35■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 BCS1LQ9Y276 419 aa21.35■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 HOXB7P09629 217 aa21.34■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.34■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.34■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLX4Q8IY92 1834 aa21.34■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.33■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYL6BP14649 208 aa21.33■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANXA1P04083 346 aa21.32■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.32■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 CNBD1Q8NA66 436 aa21.32■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.31■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.31■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.31■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.3■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 GNAI1P63096 354 aa21.3■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.3■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.3■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 NGEFQ8N5V2 710 aa21.3■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 ABCC12Q96J65 1359 aa21.29■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 WWC1Q8IX03 1113 aa21.29■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 LAMB2P55268 1798 aa21.28■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.28■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.28■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.28■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 H0YIN7 160 aa21.27■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 SRGNP10124 158 aa21.27■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 PDE6BP35913 854 aa21.27■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.27■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 NECTIN2Q92692 538 aa21.27■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.27■■□□□ 1
NME1-NME2-202ENST00000393193 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.26■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.26■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.25■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRELPP51888 382 aa21.25■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 ST5P78524 1137 aa21.25■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 COPS6Q7L5N1 327 aa21.25■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 TTLL6Q8N841 843 aa21.25■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.25■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 IL16Q14005 1332 aa21.25■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 NTSR2O95665 410 aa21.24■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.24■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.24■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 CACNA1FO60840 1977 aa21.23■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 SUSD4Q5VX71 490 aa21.23■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 STYK1Q6J9G0 422 aa21.23■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.23■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 SNED1Q8TER0 1413 aa21.22■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 GPTP24298 496 aa21.22■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 CRY2Q49AN0 593 aa21.22■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 TSPYL6Q8N831 410 aa21.22■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.21■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 MASTLQ96GX5 879 aa21.21■□□□□ 0.99
NME1-NME2-202ENST00000393193 NFKBIEO00221 500 aa21.2■□□□□ 0.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 ERFEQ4G0M1 354 aa21.2■□□□□ 0.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.2■□□□□ 0.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM177BA6PVY3 158 aa21.19■□□□□ 0.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 NYXQ9GZU5 481 aa21.19■□□□□ 0.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF521Q96K83 1311 aa21.19■□□□□ 0.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 RASSF7Q02833 373 aa21.18■□□□□ 0.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 TCIRG1Q13488 830 aa21.18■□□□□ 0.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 PARP10Q53GL7 1025 aa21.18■□□□□ 0.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 NLRP10Q86W26 655 aa21.18■□□□□ 0.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.18■□□□□ 0.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 CNKSR1Q969H4 720 aa21.18■□□□□ 0.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.18■□□□□ 0.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 HYPKQ9NX55 129 aa21.18■□□□□ 0.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 NPR1P16066 1061 aa21.17■□□□□ 0.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.17■□□□□ 0.98
NME1-NME2-202ENST00000393193 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms