RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 AP1G2O75843 785 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 RAPGEF3O95398 923 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP4CP60510 307 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 MORC4Q8TE76 937 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 CCP110O43303 1012 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 PDCL2Q8N4E4 241 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 PYGLP06737 847 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP2K2P36507 400 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM110Q86TL2 294 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 NCAPG2Q86XI2 1143 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 LMCD1Q9NZU5 365 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 SLIT1O75093 1534 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 SHTN1A0MZ66 631 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 SMARCA1P28370 1054 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 ADCY2Q08462 1091 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 SNX1Q13596 522 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 ABCC3O15438 1527 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC178Q5BJE1 867 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 UGGT1Q9NYU2 1555 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 MYRIPQ8NFW9 859 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 EXOC6Q8TAG9 804 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 CHMP5Q9NZZ3 219 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 CPS1P31327 1500 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGAP23Q9P227 1491 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 TRPC1P48995 793 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM11Q96F44 468 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 UBA5Q9GZZ9 404 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 INCENPQ9NQS7 918 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 RAD50Q92878 1312 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 MYO1CO00159 1063 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 NEBLO76041 1014 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF5P55010 431 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 USP4Q13107 963 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 LONRF1Q17RB8 773 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 CEP152O94986 1710 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 NWD1Q149M9 1564 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 PACS2Q86VP3 889 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 NEUROD6Q96NK8 337 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 TRDNQ13061 729 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 AP1ARQ63HQ0 302 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 USP33Q8TEY7 942 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 AGAP3Q96P47 875 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 OGFRQ9NZT2 677 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 USP19O94966 1318 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 IL4RP24394 825 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 HHATQ5VTY9 493 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 SYT10Q6XYQ8 523 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 BICD1Q96G01 975 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 DEF6Q9H4E7 631 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 TET3O43151 1660 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 IQGAP1P46940 1657 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 GAS2L3Q86XJ1 694 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 CFAP53Q96M91 514 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 NACA2Q9H009 215 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNA2P16389 499 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 MCTP2Q6DN12 878 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 TAX1BP1Q86VP1 789 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 SPC24Q8NBT2 197 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNB2Q92953 911 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.09□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms