RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361368.6

SMURF1-202, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-202ENST00000361368 RFC4P35249 363 aa23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-202ENST00000361368 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-202ENST00000361368 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-202ENST00000361368 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-202ENST00000361368 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-202ENST00000361368 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-202ENST00000361368 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-202ENST00000361368 MPNDQ8N594 471 aa23.46■■□□□ 1.35
SMURF1-202ENST00000361368 CASQ1P31415 396 aa23.45■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 PTPN14Q15678 1187 aa23.45■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.45■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 TSPY2A6NKD2 308 aa23.45■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 GPTP24298 496 aa23.45■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.45■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 IFFO1Q0D2I5 559 aa23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 CCDC40Q4G0X9 1142 aa23.44■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 LIG1P18858 919 aa23.43■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 KANK3Q6NY19 840 aa23.43■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.43■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 SYCE3A1L190 88 aa23.43■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 ALS2CR12Q96Q35 445 aa23.43■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.43■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 TOPBP1Q92547 1522 aa23.43■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 SHTN1A0MZ66 631 aa23.43■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.43■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.343e-7■■□□□ 14.1
SMURF1-202ENST00000361368 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 FLIIQ13045 1269 aa23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 IL27Q8NEV9 243 aa23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 NSD2O96028 1365 aa23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 UQCRHLA0A096LP55 91 aa23.41■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 UQCRHP07919 91 aa23.41■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.41■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 COMMD10Q9Y6G5 202 aa23.41■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 MACROD2A1Z1Q3 448 aa23.41■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 SYCP3Q8IZU3 236 aa23.41■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.41■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.41■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 KIF18AQ8NI77 898 aa23.41■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 ERMNQ8TAM6 284 aa23.41■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.41■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 SAMM50Q9Y512 469 aa23.41■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.4■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 NEMFO60524 1076 aa23.4■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.4■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 UBA7P41226 1012 aa23.4■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 TCERG1LQ5VWI1 586 aa23.4■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 NCOA7Q8NI08 942 aa23.4■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 GUCY1B3Q02153 619 aa23.4■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 USP37Q86T82 979 aa23.4■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 PIK3R4Q99570 1358 aa23.4■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 CCDC172P0C7W6 258 aa23.39■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 F6X3S4 739 aa23.39■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 GOLIM4O00461 696 aa23.39■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 IDEP14735 1019 aa23.39■■□□□ 1.34
SMURF1-202ENST00000361368 CCDC174Q6PII3 467 aa23.39■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 GOPCQ9HD26 462 aa23.39■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 NF2P35240 595 aa23.39■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 USP16Q9Y5T5 823 aa23.39■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 NAIPQ13075 1403 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 ADGRL1O94910 1474 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 NBPF4Q96M43 638 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 FSIP1Q8NA03 581 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 LRRC45Q96CN5 670 aa23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 PRC1O43663 620 aa23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 GSDMDP57764 484 aa23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 TIAM1Q13009 1591 aa23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 POTEB2H3BUK9 544 aa23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-202ENST00000361368 ACTN2P35609 894 aa23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms