RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 DUSP27Q5VZP5 1158 aa19.43■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 CLEC4GQ6UXB4 293 aa19.42■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa19.42■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 HOXB7P09629 217 aa19.41■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 KCNA3P22001 575 aa19.41■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 CHRNA5P30532 468 aa19.41■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa19.41■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC24Q8N4L8 307 aa19.41■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 SETDB2Q96T68 719 aa19.41■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF652Q9Y2D9 606 aa19.41■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 PRR5LQ6MZQ0 368 aa19.4■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 KIF6Q6ZMV9 814 aa19.4■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 ZBTB3Q9H5J0 574 aa19.4■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 CHPF2Q9P2E5 772 aa19.4■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa19.39■□□□□ 0.7
CSAG1-201ENST00000361211 ERVV-1B6SEH8 477 aa19.39■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 RGL2O15211 777 aa19.39■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 C8orf58Q8NAV2 365 aa19.39■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP19.39■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 NUP98P52948 1817 aa19.39■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 XAGE3Q8WTP9 111 aa19.38■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP19.38■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 IL16Q14005 1332 aa19.37■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 TSPYL6Q8N831 410 aa19.37■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 CNBD1Q8NA66 436 aa19.37■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 ATP10DQ9P241 1426 aa19.36■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 FAM177BA6PVY3 158 aa19.36■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 CCER2I3L3R5 266 aa19.36■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 GRIN3BO60391 1043 aa19.36■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 YY1P25490 414 aa19.36■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 COPS6Q7L5N1 327 aa19.36■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 BCS1LQ9Y276 419 aa19.36■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 UBN2Q6ZU65 1347 aa19.35■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 CHD4Q14839 1912 aa19.35■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 DLEC1Q9Y238 1755 aa19.34■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 FANCIQ9NVI1 1328 aa19.34■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 GPTP24298 496 aa19.34■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 WDR63Q8IWG1 891 aa19.34■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CSAG1-201ENST00000361211 NPHP1O15259 732 aa19.33■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 ST5P78524 1137 aa19.33■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 C2CD5Q86YS7 1000 aa19.33■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 BRIP1Q9BX63 1249 aa19.33■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 PIM2Q9P1W9 311 aa19.33■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF34Q8IZ26 560 aa19.32■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 ABCC12Q96J65 1359 aa19.32■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF521Q96K83 1311 aa19.31■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa19.31■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 MIER1Q8N108 512 aa19.31■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa19.3■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 PDE6BP35913 854 aa19.3■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 SUSD4Q5VX71 490 aa19.3■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 NUTM1Q86Y26 1132 aa19.3■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 HYPKQ9NX55 129 aa19.3■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 H0YIN7 160 aa19.29■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 TPTE2Q6XPS3 522 aa19.29■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 NTSR2O95665 410 aa19.28■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 ERFEQ4G0M1 354 aa19.27■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC30Q5VVM6 783 aa19.27■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 PLBD2Q8NHP8 589 aa19.27■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP19.27■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 NYXQ9GZU5 481 aa19.27■□□□□ 0.68
CSAG1-201ENST00000361211 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa19.27■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 SRGNP10124 158 aa19.26■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 TCIRG1Q13488 830 aa19.26■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa19.26■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 TTLL6Q8N841 843 aa19.26■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF428Q96B54 188 aa19.26■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 PARP10Q53GL7 1025 aa19.25■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa19.25■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa19.25■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 NLRP10Q86W26 655 aa19.25■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa19.25■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 GOLGA2Q08379 1002 aa19.24■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa19.24■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.24■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 RIC1Q4ADV7 1423 aa19.24■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 CACNA1SQ13698 1873 aa19.23■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 VAMP4O75379 141 aa19.23■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 STYK1Q6J9G0 422 aa19.23■□□□□ 0.67
CSAG1-201ENST00000361211 MASTLQ96GX5 879 aa19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 653.8 ms