RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15.77■□□□□ 0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
KCNQ1-203ENST00000345015 CACNA1FO60840 1977 aa15.76■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 SERPINB2P05120 415 aa15.76■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 MIER1Q8N108 512 aa15.76■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.75■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 FANCIQ9NVI1 1328 aa15.75■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 E9PSI1 815 aa15.75■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 TBC1D9BQ66K14 1250 aa15.75■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 C8orf58Q8NAV2 365 aa15.75■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF428Q96B54 188 aa15.75■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 GRIN3BO60391 1043 aa15.74■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 MYL6BP14649 208 aa15.74■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 KRT24Q2M2I5 525 aa15.74■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 PARP10Q53GL7 1025 aa15.74■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 TPTE2Q6XPS3 522 aa15.74■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 BRIP1Q9BX63 1249 aa15.74■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 NYXQ9GZU5 481 aa15.74■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 CHPF2Q9P2E5 772 aa15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 RIC1Q4ADV7 1423 aa15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 PDE6BP35913 854 aa15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 COPS6Q7L5N1 327 aa15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 CNBD1Q8NA66 436 aa15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 STK31Q9BXU1 1019 aa15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 NUP98P52948 1817 aa15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 PXDNLA1KZ92 1463 aa15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 ST5P78524 1137 aa15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 PROSER3Q2NL68 480 aa15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1-203ENST00000345015 CHD4Q14839 1912 aa15.7■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 VAMP4O75379 141 aa15.7■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 TCIRG1Q13488 830 aa15.7■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 HLFQ16534 295 aa15.7■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 PRR5LQ6MZQ0 368 aa15.7■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa15.7■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 KLHL34Q8N239 644 aa15.7■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 SLFN5Q08AF3 891 aa15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 TSPYL6Q8N831 410 aa15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 PIM2Q9P1W9 311 aa15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 H0YIN7 160 aa15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 YY1P25490 414 aa15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 BICDL1Q6ZP65 573 aa15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.68■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 KCNA3P22001 575 aa15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 GPR162Q16538 588 aa15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 NECTIN2Q92692 538 aa15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 NPHP1O15259 732 aa15.66■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 DPEP1P16444 411 aa15.66■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC10A5Q5PT55 438 aa15.66■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa15.65■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 ANXA1P04083 346 aa15.65■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 STYK1Q6J9G0 422 aa15.65■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 ISCA1Q9BUE6 129 aa15.65■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 UBN2Q6ZU65 1347 aa15.65■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 DLEC1Q9Y238 1755 aa15.64■□□□□ 0.1
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A0G2JLW4 131 aa15.64■□□□□ 0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 NTSR2O95665 410 aa15.64■□□□□ 0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC4A2P04920 1241 aa15.64■□□□□ 0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 CRY2Q49AN0 593 aa15.64■□□□□ 0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 KSR2Q6VAB6 950 aa15.64■□□□□ 0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.64■□□□□ 0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 NLRP10Q86W26 655 aa15.64■□□□□ 0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 CCDC191Q8NCU4 936 aa15.64■□□□□ 0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 CNKSR1Q969H4 720 aa15.64■□□□□ 0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa15.64■□□□□ 0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 SRGNP10124 158 aa15.63■□□□□ 0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 C2CD5Q86YS7 1000 aa15.63■□□□□ 0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 TTLL6Q8N841 843 aa15.63■□□□□ 0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 MASTLQ96GX5 879 aa15.63■□□□□ 0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 NPR1P16066 1061 aa15.62■□□□□ 0.09
KCNQ1-203ENST00000345015 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms