RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303927.3

CAVIN3-201, Transcript of caveolae associated protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAVIN3, Length 1,174 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3-201ENST00000303927 TTLL6Q8N841 843 aa26.15■■□□□ 1.78
CAVIN3-201ENST00000303927 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.14■■□□□ 1.78
CAVIN3-201ENST00000303927 H0YIN7 160 aa26.14■■□□□ 1.78
CAVIN3-201ENST00000303927 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 APLP1P51693 650 aa26.13■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 CHL1O00533 1208 aa26.12■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.11■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.11■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 CFAP44Q96MT7 982 aa26.11■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 CAMTA2O94983 1202 aa26.1■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 LMNB1P20700 586 aa26.1■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 CCDC27Q2M243 656 aa26.1■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.1■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.1■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 PDE6BP35913 854 aa26.09■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.09■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 PRELPP51888 382 aa26.08■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 SETDB2Q96T68 719 aa26.08■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 RRAGCQ9HB90 399 aa26.08■■□□□ 1.77
CAVIN3-201ENST00000303927 WDR90Q96KV7 1748 aa26.08■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 CNBD1Q8NA66 436 aa26.07■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.07■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 IFT57Q9NWB7 429 aa26.07■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.07■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 CCER2I3L3R5 266 aa26.06■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 NFKBIEO00221 500 aa26.06■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 GNAI1P63096 354 aa26.06■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.05■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 NPHP1O15259 732 aa26.05■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF853P0CG23 659 aa26.05■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 FSTL1Q12841 308 aa26.04■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 ERBB4Q15303 1308 aa26.04■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 NBPF26B4DH59 902 aa26.03■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 ST5P78524 1137 aa26.03■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 WWC1Q8IX03 1113 aa26.03■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 NBPF15Q8N660 670 aa26.03■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 CACNA1SQ13698 1873 aa26.02■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 NGEFQ8N5V2 710 aa26.02■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 MBIPQ9NS73 344 aa26.02■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.02■■□□□ 1.76
CAVIN3-201ENST00000303927 GLTPD2A6NH11 291 aa26.01■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 C21orf2O43822 256 aa26.01■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.01■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 HOXB7P09629 217 aa26■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 IL16Q14005 1332 aa25.98■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 RGL2O15211 777 aa25.98■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 IFFO2Q5TF58 517 aa25.98■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 STYK1Q6J9G0 422 aa25.98■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 SLX4Q8IY92 1834 aa25.98■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 SRGNP10124 158 aa25.97■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.97■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 CNKSR1Q969H4 720 aa25.97■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 MYL6BP14649 208 aa25.96■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 HTRA3P83110 453 aa25.96■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 KRT24Q2M2I5 525 aa25.96■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 MASTLQ96GX5 879 aa25.96■■□□□ 1.75
CAVIN3-201ENST00000303927 WDR63Q8IWG1 891 aa25.95■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.94■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.94■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 ERFEQ4G0M1 354 aa25.93■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.93■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
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CAVIN3-201ENST00000303927 SOGA3Q5TF21 947 aa25.92■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.92■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.92■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.91■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.91■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.91■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.9■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 NECTIN2Q92692 538 aa25.9■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 KLRG1Q96E93 195 aa25.9■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.89■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 FAM177BA6PVY3 158 aa25.89■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 NPR1P16066 1061 aa25.89■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 HLFQ16534 295 aa25.89■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.89■■□□□ 1.74
CAVIN3-201ENST00000303927 POTECB2RU33 542 aa25.88■■□□□ 1.73
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