RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.5■■□□□ 1.03
TSPAN17-201ENST00000298564 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TSPAN17-201ENST00000298564 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TSPAN17-201ENST00000298564 IL25Q9H293 177 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN17-201ENST00000298564 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TSPAN17-201ENST00000298564 ADCY9O60503 1353 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN17-201ENST00000298564 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN17-201ENST00000298564 PROSER3Q2NL68 480 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN17-201ENST00000298564 USP48Q86UV5 1035 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN17-201ENST00000298564 RAB11FIP3O75154 756 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN17-201ENST00000298564 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TSPAN17-201ENST00000298564 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN17-201ENST00000298564 SLIT3O75094 1523 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN17-201ENST00000298564 BRD1O95696 1058 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPAN17-201ENST00000298564 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TSPAN17-201ENST00000298564 PRDM4Q9UKN5 801 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN17-201ENST00000298564 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN17-201ENST00000298564 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN17-201ENST00000298564 NCAPD2Q15021 1401 aa21.45■■□□□ 1.03
TSPAN17-201ENST00000298564 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 TERF1P54274 439 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 CNPY2Q9Y2B0 182 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 MBD3O95983 291 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 AOX1Q06278 1338 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 MCCP23508 829 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 ERBB3P21860 1342 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 DYNC1I1O14576 645 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 CPA1P15085 419 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 KSR2Q6VAB6 950 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 ADCY5O95622 1261 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 CBX1P83916 185 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC39A6Q13433 755 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 FIBPO43427 364 aa21.39■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.39■■□□□ 1.02
TSPAN17-201ENST00000298564 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 ALDH1L1O75891 902 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 SPC24Q8NBT2 197 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 HYPKQ9NX55 129 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 RGPD5Q99666 1765 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 ANAPC15P60006 121 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 ATF3P18847 181 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 MCM5P33992 734 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 MTX1Q13505 466 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 CUL4AQ13619 759 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 MAP7D2Q96T17 732 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.37■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 PDIA6Q15084 440 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF790Q6PG37 636 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.36■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 MCM2P49736 904 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 CNTROBQ8N137 903 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.35■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.34■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 IGSF3O75054 1194 aa21.34■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 LINS1Q8NG48 757 aa21.34■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 MYL6BP14649 208 aa21.34■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.34■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.34■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 GRM8O00222 908 aa21.33■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 SGSM2O43147 1006 aa21.33■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 AP5Z1O43299 807 aa21.33■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.33■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 HSPA4P34932 840 aa21.33■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 CHRNA2Q15822 529 aa21.33■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 MYRIPQ8NFW9 859 aa21.33■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 SUCLG2Q96I99 432 aa21.33■■□□□ 1.01
TSPAN17-201ENST00000298564 KIF1AQ12756 1690 aa21.33■■□□□ 1
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM94Q12767 1356 aa21.33■■□□□ 1
TSPAN17-201ENST00000298564 PHKG2P15735 406 aa21.33■■□□□ 1
TSPAN17-201ENST00000298564 KAZALD1Q96I82 304 aa21.33■■□□□ 1
TSPAN17-201ENST00000298564 SPG7Q9UQ90 795 aa21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms