RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264734.2

CLDN16-201, Transcript of claudin 16, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN16, Length 3,273 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16-201ENST00000264734 NBPF9Q3BBW0 867 aa10.64□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 ZBTB9Q96C00 473 aa10.64□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 TBX22Q9Y458 520 aa10.64□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 LIG1P18858 919 aa10.64□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa10.64□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 CGNL1Q0VF96 1302 aa10.64□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 KIF3AQ9Y496 699 aa10.64□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 NINLQ9Y2I6 1382 aa10.64□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa10.63□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa10.63□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 KIF3BO15066 747 aa10.63□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa10.63□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 BCL2L12Q9HB09 334 aa10.63□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 TTC30BQ8N4P2 665 aa10.63□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 WWC3Q9ULE0 1092 aa10.62□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 NUB1Q9Y5A7 615 aa10.62□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 ZNF445P59923 1031 aa10.62□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 COMMD10Q9Y6G5 202 aa10.62□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 PEAK1Q9H792 1746 aa10.62□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 EVA1CP58658 441 aa10.62□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 CCDC146Q8IYE0 955 aa10.62□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 RNF214Q8ND24 703 aa10.62□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 PRIMPOLQ96LW4 560 aa10.62□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 C8orf37Q96NL8 207 aa10.62□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 C4orf46Q504U0 113 aa10.61□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 PRR12Q9ULL5 1215 aa10.61□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 SLFN5Q08AF3 891 aa10.61□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP10.61□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 MCTP1Q6DN14 999 aa10.61□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 AMOTL1Q8IY63 956 aa10.61□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP10.61□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 PKD1L3Q7Z443 1732 aa10.61□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa10.61□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa10.6□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 SPACA7Q96KW9 195 aa10.6□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 TRIM34Q9BYJ4 488 aa10.6□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 NFAT5O94916 1531 aa10.6□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 BAG4O95429 457 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10.6□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 CFAP69A5D8W1 941 aa10.6□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 IDI1Q13907 227 aa10.6□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa10.6□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 CHMP4CQ96CF2 233 aa10.6□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 TRERF1Q96PN7 1200 aa10.6□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 RFX1P22670 979 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 PPP4CP60510 307 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 IGBP1P78318 339 aa10.59□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CLDN16-201ENST00000264734 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP10.58□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 PTPROQ16827 1216 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 TIGD1Q96MW7 591 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 KLF15Q9UIH9 416 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 PAPPAQ13219 1627 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 CCDC66A2RUB6 948 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 GIPC2Q8TF65 315 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa10.58□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 ERICH4A6NGS2 130 aa10.57□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 PDE3AQ14432 1141 aa10.57□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 LNPKQ9C0E8 428 aa10.57□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 INSRP06213 1382 aa10.57□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 LRRC37A3O60309 1634 aa10.57□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 NGEFQ8N5V2 710 aa10.57□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 QSER1Q2KHR3 1735 aa10.57□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 ZNF521Q96K83 1311 aa10.57□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP10.57□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 SNX21Q969T3 373 aa10.57□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 SYCE3A1L190 88 aa10.56□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 STK25O00506 426 aa10.56□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 CAPN2P17655 700 aa10.56□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 NLGN1Q8N2Q7 840 aa10.56□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 SLC20A2Q08357 652 aa10.56□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 PHLPP1O60346 1717 aa10.56□□□□□ -0.72
CLDN16-201ENST00000264734 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms