RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP17.9■□□□□ 0.46
SYP-201ENST00000263233 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SYP-201ENST00000263233 NUTM2GQ5VZR2 741 aa17.9■□□□□ 0.46
SYP-201ENST00000263233 MYRIPQ8NFW9 859 aa17.9■□□□□ 0.46
SYP-201ENST00000263233 KDM4AO75164 1064 aa17.9■□□□□ 0.46
SYP-201ENST00000263233 CCDC83Q8IWF9 413 aa17.9■□□□□ 0.46
SYP-201ENST00000263233 TTC41PQ6P2S7 1318 aa17.9■□□□□ 0.46
SYP-201ENST00000263233 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa17.89■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 GJB2P29033 226 aa17.89■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 PTH1RQ03431 593 aa17.89■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 MTMR6Q9Y217 621 aa17.89■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 DTNBO60941 627 aa17.89■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 ADCK5Q3MIX3 580 aa17.89■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa17.89■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 GIMAP6Q6P9H5 292 aa17.89■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 USHBP1Q8N6Y0 703 aa17.89■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 DNAAF4Q8WXU2 420 aa17.89■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 CHPF2Q9P2E5 772 aa17.89■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 PI4KAP2A4QPH2 592 aa17.88■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 HSPA2P54652 639 aa17.88■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa17.88■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa17.88■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa17.88■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 VPS53Q5VIR6 699 aa17.88■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 PDRG1Q9NUG6 133 aa17.88■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 ST3GAL1Q11201 340 aa17.87■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 KLHL34Q8N239 644 aa17.87■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 RUFY2Q8WXA3 655 aa17.87■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 KCNB2Q92953 911 aa17.87■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 PRIMPOLQ96LW4 560 aa17.87■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa17.87■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 AP5Z1O43299 807 aa17.86■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 SPTLC3Q9NUV7 552 aa17.86■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 TM6SF1Q9BZW5 370 aa17.86■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 ADCY9O60503 1353 aa17.85■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 LGR6Q9HBX8 967 aa17.85■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 KCNQ3O43525 872 aa17.84■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 ANXA1P04083 346 aa17.84■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 HOXB7P09629 217 aa17.84■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa17.84■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 KDM3BQ7LBC6 1761 aa17.84■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 USP54Q70EL1 1684 aa17.84■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 MTX1Q13505 466 aa17.84■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 NECTIN1Q15223 517 aa17.84■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 ME3Q16798 604 aa17.84■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 ARID3AQ99856 593 aa17.84■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 ECHDC1Q9NTX5 307 aa17.84■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 PLCB2Q00722 1185 aa17.83■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 EID1Q9Y6B2 187 aa17.83■□□□□ 0.45
SYP-201ENST00000263233 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP17.83■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 ABTB2Q8N961 1025 aa17.83■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 TBX22Q9Y458 520 aa17.83■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 TSC1Q92574 1164 aa17.82■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 NECAB1Q8N987 351 aa17.82■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 CCDC171Q6TFL3 1326 aa17.82■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 ZNF710Q8N1W2 664 aa17.81■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 KCNF1Q9H3M0 494 aa17.81■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 TPCN1Q9ULQ1 816 aa17.81■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 EVI5LQ96CN4 794 aa17.81■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 ANKARQ7Z5J8 1434 aa17.81■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 CREB3L3Q68CJ9 461 aa17.8■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 TTC6Q86TZ1 520 aa17.8■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 KIAA1524Q8TCG1 905 aa17.8■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 GPATCH3Q96I76 525 aa17.8■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 CCDC192P0DO97 292 aa17.79■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 CHMP4AQ9BY43 222 aa17.79■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 PYCARDQ9ULZ3 195 aa17.79■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 LTN1O94822 1766 aa17.79■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 NBPF6Q5VWK0 638 aa17.79■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 NBPF4Q96M43 638 aa17.79■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 SLIT1O75093 1534 aa17.78■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 CDC37L1Q7L3B6 337 aa17.78■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 AACSQ86V21 672 aa17.78■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 ERC1Q8IUD2 1116 aa17.78■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 MAP4K1Q92918 833 aa17.78■□□□□ 0.44
SYP-201ENST00000263233 FAM227BQ96M60 508 aa17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms