RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.13■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.13■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 PTPRCP08575 1304 aa22.12■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 MSL1Q68DK7 614 aa22.12■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 G2E3Q7L622 706 aa22.12■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.12■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.11■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 TJP1Q07157 1748 aa22.11■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 NECTIN2Q92692 538 aa22.11■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 ARXQ96QS3 562 aa22.11■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 STK31Q9BXU1 1019 aa22.11■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.11■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.1■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.1■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 IGHDP01880 384 aa22.08■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.08■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 USP16Q9Y5T5 823 aa22.08■■□□□ 1.13
SRSF1-201ENST00000258962 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.07■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 ZPR1O75312 459 aa22.06■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.06■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 A1BGP04217 495 aa22.06■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.05■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 FLIIQ13045 1269 aa22.05■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 A0A087WZG4 1122 aa22.04■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 KLHL34Q8N239 644 aa22.03■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.03■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 COL15A1P39059 1388 aa22.03■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 GYS1P13807 737 aa22.02■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.02■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SRSF1-201ENST00000258962 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.01■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 F6X3S4 739 aa22.01■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 MMP10P09238 476 aa22.01■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 SKAP1Q86WV1 359 aa22.01■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.01■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 NARFQ9UHQ1 456 aa22.01■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 SYT17Q9BSW7 474 aa22■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.98■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 ANXA1P04083 346 aa21.97■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.97■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.97■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.96■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 PROSER3Q2NL68 480 aa21.96■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 NBPF26B4DH59 902 aa21.96■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.96■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 NBPF15Q8N660 670 aa21.96■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.96■■□□□ 1.11
SRSF1-201ENST00000258962 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SRSF1-201ENST00000258962 C4AP0C0L4 1744 aa21.94■■□□□ 1.1
SRSF1-201ENST00000258962 PDIA6Q15084 440 aa21.94■■□□□ 1.1
SRSF1-201ENST00000258962 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.94■■□□□ 1.1
SRSF1-201ENST00000258962 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
SRSF1-201ENST00000258962 ATP10DQ9P241 1426 aa21.93■■□□□ 1.1
SRSF1-201ENST00000258962 ADCY9O60503 1353 aa21.92■■□□□ 1.1
SRSF1-201ENST00000258962 ERBB4Q15303 1308 aa21.92■■□□□ 1.1
SRSF1-201ENST00000258962 MYL6BP14649 208 aa21.92■■□□□ 1.1
SRSF1-201ENST00000258962 MEIS3Q99687 375 aa21.92■■□□□ 1.1
SRSF1-201ENST00000258962 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.91■■□□□ 1.1
SRSF1-201ENST00000258962 HYPKQ9NX55 129 aa21.91■■□□□ 1.1
SRSF1-201ENST00000258962 TM4SF1P30408 202 aa21.9■■□□□ 1.1
SRSF1-201ENST00000258962 NFIXQ14938 502 aa21.9■■□□□ 1.1
SRSF1-201ENST00000258962 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.9■■□□□ 1.1
SRSF1-201ENST00000258962 CAMTA2O94983 1202 aa21.9■■□□□ 1.1
SRSF1-201ENST00000258962 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.9■■□□□ 1.1
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.9■■□□□ 1.1
SRSF1-201ENST00000258962 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.89■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.89■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 DDR1Q08345 913 aa21.88■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.88■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 SMC5Q8IY18 1101 aa21.88■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.88■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.87■■□□□ 1.09
SRSF1-201ENST00000258962 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.87■■□□□ 1.09
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