RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHDP01880 384 aa33.03■■■□□ 2.88
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPYL6Q8N831 410 aa33.03■■■□□ 2.88
CAPNS1-201ENST00000246533 C4AP0C0L4 1744 aa33.03■■■□□ 2.88
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF5P55010 431 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
CAPNS1-201ENST00000246533 FLAD1Q8NFF5 587 aa33.02■■■□□ 2.88
CAPNS1-201ENST00000246533 IL16Q14005 1332 aa33.02■■■□□ 2.88
CAPNS1-201ENST00000246533 LAMB4A4D0S4 1761 aa33.02■■■□□ 2.88
CAPNS1-201ENST00000246533 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP33.02■■■□□ 2.88
CAPNS1-201ENST00000246533 MTFR1LQ9H019 292 aa33.01■■■□□ 2.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ANXA1P04083 346 aa33■■■□□ 2.87
CAPNS1-201ENST00000246533 COL15A1P39059 1388 aa33■■■□□ 2.87
CAPNS1-201ENST00000246533 RFC4P35249 363 aa33■■■□□ 2.87
CAPNS1-201ENST00000246533 PTGER2P43116 358 aa33■■■□□ 2.87
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
CAPNS1-201ENST00000246533 MYL6BP14649 208 aa32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-201ENST00000246533 ADRA2BP18089 450 aa32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-201ENST00000246533 PROSER3Q2NL68 480 aa32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa32.98■■■□□ 2.87
CAPNS1-201ENST00000246533 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-201ENST00000246533 PDIA6Q15084 440 aa32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC16A10Q8TF71 515 aa32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SPON1Q9HCB6 807 aa32.97■■■□□ 2.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SGIP1Q9BQI5 828 aa32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-201ENST00000246533 ARXQ96QS3 562 aa32.96■■■□□ 2.87
CAPNS1-201ENST00000246533 GYS1P13807 737 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-201ENST00000246533 USPL1Q5W0Q7 1092 aa32.95■■■□□ 2.87
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CAPNS1-201ENST00000246533 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
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CAPNS1-201ENST00000246533 BCL2L12Q9HB09 334 aa32.92■■■□□ 2.86
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CAPNS1-201ENST00000246533 LRP10Q7Z4F1 713 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-201ENST00000246533 COG6Q9Y2V7 657 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-201ENST00000246533 CHPF2Q9P2E5 772 aa32.91■■■□□ 2.86
CAPNS1-201ENST00000246533 NARFQ9UHQ1 456 aa32.9■■■□□ 2.86
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZPR1O75312 459 aa32.89■■■□□ 2.86
CAPNS1-201ENST00000246533 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
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CAPNS1-201ENST00000246533 TTLL7Q6ZT98 887 aa32.89■■■□□ 2.85
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CAPNS1-201ENST00000246533 MYH16Q9H6N6 1097 aa32.87■■■□□ 2.85
CAPNS1-201ENST00000246533 COL24A1Q17RW2 1714 aa32.87■■■□□ 2.85
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CAPNS1-201ENST00000246533 LRP5O75197 1615 aa32.84■■■□□ 2.85
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CAPNS1-201ENST00000246533 XAGE3Q8WTP9 111 aa32.8■■■□□ 2.84
CAPNS1-201ENST00000246533 POLD1P28340 1107 aa32.79■■■□□ 2.84
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CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D32Q96NH3 1257 aa32.79■■■□□ 2.84
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB3Q9H5J0 574 aa32.79■■■□□ 2.84
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CAPNS1-201ENST00000246533 TM4SF1P30408 202 aa32.78■■■□□ 2.84
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CAPNS1-201ENST00000246533 SEC24BO95487 1268 aa32.75■■■□□ 2.83
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CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL34Q8N239 644 aa32.75■■■□□ 2.83
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CAPNS1-201ENST00000246533 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa32.74■■■□□ 2.83
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CAPNS1-201ENST00000246533 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
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CAPNS1-201ENST00000246533 ANTXR1Q9H6X2 564 aa32.73■■■□□ 2.83
CAPNS1-201ENST00000246533 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa32.73■■■□□ 2.83
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CAPNS1-201ENST00000246533 HYPKQ9NX55 129 aa32.71■■■□□ 2.83
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC4A2P04920 1241 aa32.7■■■□□ 2.83
CAPNS1-201ENST00000246533 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa32.7■■■□□ 2.83
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF428Q96B54 188 aa32.69■■■□□ 2.82
CAPNS1-201ENST00000246533 PARP3Q9Y6F1 533 aa32.69■■■□□ 2.82
CAPNS1-201ENST00000246533 RLBP1P12271 317 aa32.69■■■□□ 2.82
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC24Q8N4L8 307 aa32.68■■■□□ 2.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVV-1B6SEH8 477 aa32.67■■■□□ 2.82
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC4GQ6UXB4 293 aa32.67■■■□□ 2.82
CAPNS1-201ENST00000246533 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
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