RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 ZNF853P0CG23 659 aa39.92■■■■□ 3.98
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INO80B-201ENST00000233331 PRR5LQ6MZQ0 368 aa39.92■■■■□ 3.98
INO80B-201ENST00000233331 TTLL7Q6ZT98 887 aa39.92■■■■□ 3.98
INO80B-201ENST00000233331 PIM2Q9P1W9 311 aa39.92■■■■□ 3.98
INO80B-201ENST00000233331 NPHP1O15259 732 aa39.91■■■■□ 3.98
INO80B-201ENST00000233331 HLFQ16534 295 aa39.91■■■■□ 3.98
INO80B-201ENST00000233331 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa39.91■■■■□ 3.98
INO80B-201ENST00000233331 CNBD1Q8NA66 436 aa39.9■■■■□ 3.98
INO80B-201ENST00000233331 PDIA6Q15084 440 aa39.89■■■■□ 3.98
INO80B-201ENST00000233331 CCDC24Q8N4L8 307 aa39.89■■■■□ 3.98
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INO80B-201ENST00000233331 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa39.87■■■■□ 3.97
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INO80B-201ENST00000233331 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa39.84■■■■□ 3.97
INO80B-201ENST00000233331 DUSP27Q5VZP5 1158 aa39.84■■■■□ 3.97
INO80B-201ENST00000233331 DLEC1Q9Y238 1755 aa39.84■■■■□ 3.97
INO80B-201ENST00000233331 NUP98P52948 1817 aa39.84■■■■□ 3.97
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INO80B-201ENST00000233331 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa39.82■■■■□ 3.97
INO80B-201ENST00000233331 FAM177BA6PVY3 158 aa39.81■■■■□ 3.96
INO80B-201ENST00000233331 H0YIN7 160 aa39.81■■■■□ 3.96
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INO80B-201ENST00000233331 WWC1Q8IX03 1113 aa39.81■■■■□ 3.96
INO80B-201ENST00000233331 ATP10DQ9P241 1426 aa39.81■■■■□ 3.96
INO80B-201ENST00000233331 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP39.8■■■■□ 3.96
INO80B-201ENST00000233331 CHPF2Q9P2E5 772 aa39.8■■■■□ 3.96
INO80B-201ENST00000233331 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
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INO80B-201ENST00000233331 TPTE2Q6XPS3 522 aa39.77■■■■□ 3.96
INO80B-201ENST00000233331 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa39.77■■■■□ 3.96
INO80B-201ENST00000233331 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
INO80B-201ENST00000233331 XAGE3Q8WTP9 111 aa39.77■■■■□ 3.96
INO80B-201ENST00000233331 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa39.77■■■■□ 3.96
INO80B-201ENST00000233331 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
INO80B-201ENST00000233331 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
INO80B-201ENST00000233331 COPS6Q7L5N1 327 aa39.76■■■■□ 3.96
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INO80B-201ENST00000233331 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
INO80B-201ENST00000233331 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP39.73■■■■□ 3.951e-6■■■□□ 16.4
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INO80B-201ENST00000233331 NUTM1Q86Y26 1132 aa39.66■■■■□ 3.94
INO80B-201ENST00000233331 HYPKQ9NX55 129 aa39.66■■■■□ 3.94
INO80B-201ENST00000233331 ADCY9O60503 1353 aa39.65■■■■□ 3.94
INO80B-201ENST00000233331 ABCC12Q96J65 1359 aa39.65■■■■□ 3.94
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INO80B-201ENST00000233331 SUSD4Q5VX71 490 aa39.65■■■■□ 3.94
INO80B-201ENST00000233331 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa39.64■■■■□ 3.94
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INO80B-201ENST00000233331 TSPYL6Q8N831 410 aa39.63■■■■□ 3.93
INO80B-201ENST00000233331 MASTLQ96GX5 879 aa39.63■■■■□ 3.93
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INO80B-201ENST00000233331 WDR63Q8IWG1 891 aa39.62■■■■□ 3.93
INO80B-201ENST00000233331 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa39.61■■■■□ 3.93
INO80B-201ENST00000233331 CNKSR1Q969H4 720 aa39.61■■■■□ 3.93
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INO80B-201ENST00000233331 CACNA1SQ13698 1873 aa39.6■■■■□ 3.93
INO80B-201ENST00000233331 FANCIQ9NVI1 1328 aa39.59■■■■□ 3.93
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INO80B-201ENST00000233331 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa39.58■■■■□ 3.93
INO80B-201ENST00000233331 CHMP4AQ9BY43 222 aa39.58■■■■□ 3.93
INO80B-201ENST00000233331 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
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INO80B-201ENST00000233331 TCIRG1Q13488 830 aa39.57■■■■□ 3.93
INO80B-201ENST00000233331 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa39.56■■■■□ 3.92
INO80B-201ENST00000233331 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
INO80B-201ENST00000233331 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
INO80B-201ENST00000233331 RASSF7Q02833 373 aa39.55■■■■□ 3.92
INO80B-201ENST00000233331 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
INO80B-201ENST00000233331 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
INO80B-201ENST00000233331 RIC1Q4ADV7 1423 aa39.55■■■■□ 3.92
INO80B-201ENST00000233331 SLX4Q8IY92 1834 aa39.54■■■■□ 3.92
INO80B-201ENST00000233331 C21orf2O43822 256 aa39.54■■■■□ 3.92
INO80B-201ENST00000233331 C9orf131Q5VYM1 1079 aa39.54■■■■□ 3.92
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