RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rad54l2	Q99NG0	1466 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tbc1d2	B1AVH7	922 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm3739	L7N296	216 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Neu1	O35657	409 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cyp8b1	O88962	500 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	E2f5	Q61502	335 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fchsd1	Q6PFY1	688 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cep120	Q7TSG1	988 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Clm	Q7TSN2	230 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Arid5b	Q8BM75	1188 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gphn	Q8BUV3	769 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc187	Q8C5V8	958 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Inpp5f	Q8CDA1	1132 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Psmd2	Q8VDM4	908 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Spaca1	Q9DA48	305 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmub1	Q9JMG3	245 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Clcn2	Q9R0A1	908 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Duxf3	A0A0N4SV92	674 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm3252	E9PUT9	216 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm3002	E9PW72	216 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm3468	E9QAJ8	216 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm3164	L7N2B9	238 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Akap10	O88845	662 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm11487	Q5RIS0	354 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wdr44	Q6NVE8	915 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q8BTG6	205 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ephb1	Q8CBF3	984 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sik2	Q8CFH6	931 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gnal	Q8CGK7	381 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mpst	Q99J99	297 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rab27a	Q9ERI2	221 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rbck1	Q9WUB0	508 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zfp651	E9PZ11	729 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Elf1	Q60775	612 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fmnl3	Q6ZPF4	1028 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Noc4l	Q8BHY2	516 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam43a	Q8BUP8	424 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rpn1	Q91YQ5	608 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ttc1	Q91Z38	292 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mei1	Q9D4I2	1268 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Appbp2	Q9DAX9	585 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zcchc17	Q9ESX4	241 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cyp2ab1	S4R196	498 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prdm11	A2AGX3	565 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q3UUX7	111 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sfi1	Q3UZY0	1216 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Thrap3	Q569Z6	951 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ecm1	Q61508	559 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppp2r5a	Q6PD03	486 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Smarcal1	Q8BJL0	910 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	R3hcc1	Q8BSI6	488 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Eno4	Q8C042	619 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nlrp10	Q8CCN1	673 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rpa1	Q8VEE4	623 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nkap	Q9D0F4	415 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	4933428M09Rik	Q9D3X3	192 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tpcn1	Q9EQJ0	817 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc173	A0JLY1	547 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ms4a1	P19437	291 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Adamts19	P59509	1210 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Specc1	Q5SXY1	1067 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Taf1c	Q6PDZ2	836 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gramd1b	Q80TI0	738 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Metrn	Q8C1Q4	291 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trim8	Q99PJ2	551 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ttpal	Q9D3D0	343 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sept3	Q9Z1S5	350 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mtmr1	Q9Z2C4	669 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prrt4	B2RU40	902 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hsd3b6	O35469	373 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Abl1	P00520	1123 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mum1l1	Q4VA55	681 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam196b	Q6GQV1	535 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mapre3	Q6PER3	281 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rfc4	Q99J62	364 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ms4a4c	Q9D3F6	226 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Limd1	Q9QXD8	668 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dnajc25	A2ALW5	357 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atp8a1	P70704	1164 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cblb	Q3TTA7	982 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Capn3	Q64691	821 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wdr3	Q8BHB4	942 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Frs2	Q8C180	508 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tex19.1	Q99MV2	351 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tcam1	Q99NB3	548 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rsf1	E9PWW9	1441 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Inhbe	O08717	350 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccng2	O08918	344 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fkbpl	O35450	347 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pfkfb2	P70265	519 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dusp27	Q148W8	1138 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dennd1b	Q3U1T9	766 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fdxacb1	Q3UY23	622 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cyp2c67	Q569X9	491 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zbtb4	Q5F293	982 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ski	Q60698	725 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Scnn1a	Q61180	699 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gemin4	Q6P6L6	1058 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rubcn	Q80U62	956 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ctdspl2	Q8BG15	465 aa		5.02	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.2 ms