RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021990.3

Ptdss1-201, Transcript of Phosphatidylserine synthase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptdss1, Length 3,424 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Zscan25B2RX31 543 aa17.27■□□□□ 0.36
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 PplQ9R269 1755 aa17.27■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Lmod3E9QA62 571 aa17.27■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 LratQ9JI60 231 aa17.27■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Dixdc1Q80Y83 711 aa17.26■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ccdc178Q8CDV0 866 aa17.26■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Abcc10Q8R4P9 1501 aa17.26■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Rnf20Q5DTM8 973 aa17.25■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ttll7A4Q9F0 912 aa17.25■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ak2Q9WTP6 239 aa17.25■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Taf7Q9R1C0 341 aa17.25■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ms4a2P20490 235 aa17.24■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ano8Q6PB70 1060 aa17.24■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Taf5lQ91WQ5 589 aa17.24■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Atg3Q9CPX6 314 aa17.24■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Irf5P56477 497 aa17.24■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Soga3Q6NZL0 945 aa17.24■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Dhx38Q80X98 1228 aa17.24■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 OptnQ8K3K8 584 aa17.24■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Speer4bQ9D9F7 267 aa17.24■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 NmiO35309 314 aa17.23■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Bicd2Q921C5 820 aa17.23■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Pdzd9Q9D9M4 266 aa17.23■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Col1a2Q01149 1372 aa17.23■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Pnpla7A2AJ88 1352 aa17.23■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Farp2Q91VS8 1065 aa17.23■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Wdr17E9Q271 1322 aa17.23■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Adcy9P51830 1353 aa17.22■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa17.22■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm7361D3Z6R1 267 aa17.22■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa17.22■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm1979E9QAN3 267 aa17.22■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm5862K7N5V5 267 aa17.22■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm10220K7N660 267 aa17.22■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Pkp1P97350 728 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 NaspQ99MD9 773 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 PigbQ9JJQ0 542 aa17.22■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ercc3P49135 783 aa17.22■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 ThemisQ8BGW0 636 aa17.22■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Fam228bQ497Q6 232 aa17.22■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 BcanQ61361 883 aa17.22■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa17.22■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Adora1Q60612 326 aa17.21■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Slit3Q9WVB4 1523 aa17.21■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Adcy5P84309 1262 aa17.21■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Kdm4aQ8BW72 1064 aa17.21■□□□□ 0.35
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Atf3Q60765 181 aa17.21■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa17.21■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ube2hP62257 183 aa17.2■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ncoa4Q5U4H9 625 aa17.2■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Mrpl50Q8VDT9 159 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ccdc7Q9D541 371 aa17.2■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ugt1a5B2RT14 529 aa17.2■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Fkbp5Q64378 456 aa17.2■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Slain2Q8CI08 581 aa17.2■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gzf1Q4VBD9 706 aa17.19■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Vps54Q5SPW0 977 aa17.19■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Rad17Q6NXW6 688 aa17.19■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Snx13Q6PHS6 957 aa17.19■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa17.19■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Irgm2A0A140LIF8 407 aa17.19■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Pip4k2bQ80XI4 416 aa17.19■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Med4Q9CQA5 270 aa17.19■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa17.18■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Igfbp6P47880 238 aa17.18■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Tpm2P58774 284 aa17.18■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Camta1A2A891 1682 aa17.18■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Kdm6aO70546 1401 aa17.18■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Nphp3Q7TNH6 1325 aa17.18■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 RictorQ6QI06 1708 aa17.18■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Atf7Q8R0S1 413 aa17.18■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Abcc4E9Q236 1325 aa17.17■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ccdc173A0JLY1 547 aa17.17■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Wdr93Q402B2 695 aa17.17■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa17.17■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 CrklP47941 303 aa17.17■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Igflr1Q3U4N7 345 aa17.17■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ndufa8Q9DCJ5 172 aa17.17■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Cfap73J3QPZ5 306 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Hoxa7P02830 229 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Mctp1E9PV86 951 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Sgsm2Q80U12 1005 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Golim4Q8BXA1 655 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Phkg2Q9DB30 406 aa17.16■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Aox2Q5SGK3 1345 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Cct2P80314 535 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Clcn1Q64347 994 aa17.15■□□□□ 0.34
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 R3hcc1Q8BSI6 488 aa17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.5 ms