RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001711.5

Hoxc6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc6, Length 1,581 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gimap8Q75N62 688 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cwc25Q9DBF7 416 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dctn1O08788 1281 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Npy5rO70342 466 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Wdhd1P59328 1117 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 PsdQ5DTT2 1024 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Soga3Q6NZL0 945 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 MvpQ9EQK5 861 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ehd4Q9EQP2 541 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Stox1B2RQL2 990 aa23.51■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ripor2Q80U16 1078 aa23.51■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa23.5■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pde4bB1AWC9 736 aa23.5■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Map3k13Q1HKZ5 959 aa23.5■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Casz1Q9CWL2 1761 aa23.5■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ankrd44B2RXR6 993 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 CltaO08585 235 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Susd4Q8BH32 490 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mrc1Q61830 1456 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 NmiO35309 314 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arid3aQ62431 601 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Phf23Q8BSN5 401 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Duox1A2AQ92 1551 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prdm11A2AGX3 565 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Grm8P47743 908 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fam213aQ9CYH2 218 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Aldh1l2Q8K009 923 aa23.45■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cyp19a1P28649 503 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fgd1P52734 960 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lrp5Q91VN0 1614 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 GptQ8QZR5 496 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slurp2P0DP59 97 aa23.43■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dbndd1Q9CZ00 160 aa23.43■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Myh1Q5SX40 1942 aa23.42■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mum1Q6DID5 682 aa23.42■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Clca2Q8BG22 942 aa23.42■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Foxo4Q9WVH3 505 aa23.42■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Foxo3Q9WVH4 672 aa23.42■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ambra1A2AH22 1300 aa23.42■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cops6O88545 324 aa23.41■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 En2P09066 324 aa23.41■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 CanxP35564 591 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ttc19Q8CC21 365 aa23.41■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 StrcQ8VIM6 1809 aa23.41■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Igflr1Q3U4N7 345 aa23.4■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tspyl2Q7TQI8 677 aa23.4■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tnnt3Q9QZ47 272 aa23.4■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kif13bA0A286YCV9 1847 aa23.4■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Stk36Q69ZM6 1316 aa23.4■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Znf521Q6KAS7 1311 aa23.39■■□□□ 1.34
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gnat3Q3V3I2 354 aa23.39■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prkar2bP31324 416 aa23.38■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cyp7a1Q64505 503 aa23.38■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 St5Q924W7 1134 aa23.38■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kcnq2Q9Z351 759 aa23.38■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Greb1lB9EJV3 1913 aa23.37■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Smc4Q8CG47 1286 aa23.37■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa23.37■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Magea1O89006 320 aa23.36■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Magea5O89009 320 aa23.36■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ttc14Q9CSP9 761 aa23.36■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Magea2Q9R2A2 320 aa23.36■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 NeflP08551 543 aa23.35■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cct4P80315 539 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 NexnQ7TPW1 607 aa23.35■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ppm1fQ8CGA0 452 aa23.35■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cfap70D3YVL2 1141 aa23.34■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zbtb38Q3LR78 1197 aa23.34■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 BcanQ61361 883 aa23.34■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Trim34bJ3QNR8 485 aa23.33■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Eva1cP58659 440 aa23.33■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tlr7P58681 1050 aa23.33■■□□□ 1.33
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 GpkowQ56A08 488 aa23.32■■□□□ 1.32
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tceal9Q9DD24 104 aa23.32■■□□□ 1.32
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Triml2E9PW10 424 aa23.31■■□□□ 1.32
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nlrp9bQ66X22 1003 aa23.31■■□□□ 1.32
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 InsrrQ9WTL4 1300 aa23.31■■□□□ 1.32
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 AampJ3QN89 436 aa23.31■■□□□ 1.32
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Strip1Q8C079 837 aa23.31■■□□□ 1.32
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa23.29■■□□□ 1.32
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tango6Q8C3S2 1079 aa23.29■■□□□ 1.32
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Aknad1E9Q8N6 675 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tm6sf1P58749 370 aa23.27■■□□□ 1.32
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ubxn2bQ0KL01 331 aa23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 90.3 ms