RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RLIMQ9NVW2 624 aa20.17■□□□□ 0.82
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANKMY1Q9P2S6 941 aa20.17■□□□□ 0.82
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CES1P1Q9UKY3 287 aa20.17■□□□□ 0.82
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KLHL20Q9Y2M5 609 aa20.17■□□□□ 0.82
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.17■□□□□ 0.82
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BTN3A2P78410 334 aa20.16■□□□□ 0.82
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa20.16■□□□□ 0.82
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRIM48Q8IWZ4 208 aa20.16■□□□□ 0.82
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC44A3Q8N4M1 653 aa20.16■□□□□ 0.82
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR9Q2Q8NGE9 314 aa20.16■□□□□ 0.82
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCL4L1Q8NHW4 92 aa20.16■□□□□ 0.82
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MIPOL1Q8TD10 442 aa20.16■□□□□ 0.82
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 APH1BQ8WW43 257 aa20.16■□□□□ 0.82
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FUNDC2Q9BWH2 189 aa20.16■□□□□ 0.82
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C18orf63Q68DL7 685 aa20.15■□□□□ 0.82
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC116Q8IYX3 515 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AQP11Q8NBQ7 271 aa20.15■□□□□ 0.82
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF576Q9H609 170 aa20.15■□□□□ 0.82
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PHF11Q9UIL8 331 aa20.15■□□□□ 0.82
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LIM2P55344 173 aa20.14■□□□□ 0.81
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TCEA2Q15560 299 aa20.14■□□□□ 0.81
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BTBD2Q9BX70 525 aa20.14■□□□□ 0.81
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCNK12Q9HB15 430 aa20.14■□□□□ 0.81
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A0A0G2JPF8 293 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C2CD4DB7Z1M9 353 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MPZL2O60487 215 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VIPP01282 170 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 H1F0P07305 194 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UGT2B7P16662 529 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCR5P51681 352 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRKAG1P54619 331 aa20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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