RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559578.1

PBX1-217, Transcript of PBX homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PBX1, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1-217ENST00000559578 OR10G3Q8NGC4 313 aa22■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 ATOH8Q96SQ7 321 aa22■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 DOHHQ9BU89 302 aa22■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 WWTR1Q9GZV5 400 aa22■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 SLC6A15Q9H2J7 730 aa22■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 IGSF5Q9NSI5 407 aa22■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 RNF14Q9UBS8 474 aa22■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 EDARQ9UNE0 448 aa22■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 FAM221AA4D161 298 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 LRRC3CA6NJW4 275 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 UBXN8O00124 270 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 PLPP1O14494 284 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 GPR75O95800 540 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 SLC35E2BP0CK96 405 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 CRABP2P29373 138 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 UQCRC1P31930 480 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 GMPRP36959 345 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 PHEXP78562 749 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 TAGAPQ8N103 731 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 RNF175Q8N4F7 328 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 DOK4Q8TEW6 326 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 RIT1Q92963 219 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 ERP44Q9BS26 406 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 TMUB1Q9BVT8 246 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 CXXC4Q9H2H0 198 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 PROK2Q9HC23 129 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 DMRT3Q9NQL9 472 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa21.99■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 ABCA4P78363 2273 aa21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 OR6C76A6NM76 312 aa21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 SYT5O00445 386 aa21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 DVL2O14641 736 aa21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 PROM1O43490 865 aa21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 TRPC1P48995 793 aa21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 DLG1Q12959 904 aa21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 NTRK2Q16620 822 aa21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 TBCELQ5QJ74 424 aa21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 TMEM198Q66K66 360 aa21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 CMC1Q7Z7K0 106 aa21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 TEX9Q8N6V9 391 aa21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 PPM1NQ8N819 430 aa21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 REPS1Q96D71 796 aa21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 ZNF358Q9NW07 568 aa21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa21.98■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa21.97■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 FAM187AA6NFU0 413 aa21.97■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 SYCE1LA8MT33 242 aa21.97■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 AHRRA9YTQ3 701 aa21.97■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 TP53I11O14683 189 aa21.97■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 C1QAP02745 245 aa21.97■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 GDF1P27539 372 aa21.97■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 SLC37A1P57057 533 aa21.97■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 EBPQ15125 230 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 LIPJQ5W064 366 aa21.97■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 SEM1Q6ZVN7 128 aa21.97■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 DIO2Q92813 273 aa21.97■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 ZNF597Q96LX8 424 aa21.97■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 ACTR8Q9H981 624 aa21.97■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 WDR41Q9HAD4 459 aa21.97■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 RASSF1Q9NS23 344 aa21.97■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 CRIM1Q9NZV1 1036 aa21.97■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa21.97■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 ANKRD33BA6NCL7 494 aa21.96■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 GLOD5A6NK44 160 aa21.96■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 CAPN14A8MX76 684 aa21.96■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 RAD51CO43502 376 aa21.96■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 FAM155BO75949 473 aa21.96■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 LRATO95237 230 aa21.96■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 NR2F6P10588 404 aa21.96■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 BMP5P22003 454 aa21.96■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 GALNSP34059 522 aa21.96■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 ASCL1P50553 236 aa21.96■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 GPX6P59796 221 aa21.96■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 RPS13P62277 151 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 PPP2R2AP63151 447 aa21.96■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 DUSP8Q13202 625 aa21.96■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa21.96■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 CYP20A1Q6UW02 462 aa21.96■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa21.96■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 ASB4Q9Y574 426 aa21.96■■□□□ 1.11
PBX1-217ENST00000559578 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa21.95■■□□□ 1.1
PBX1-217ENST00000559578 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PBX1-217ENST00000559578 EPPINO95925 133 aa21.95■■□□□ 1.1
PBX1-217ENST00000559578 RPS6KA2Q15349 733 aa21.95■■□□□ 1.1
PBX1-217ENST00000559578 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
PBX1-217ENST00000559578 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms