RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 SYNPOQ8N3V7 929 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 RADILQ96JH8 1075 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 RMI1Q9H9A7 625 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1B0GVC2 190 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 HHEXQ03014 270 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 CEACAM19Q7Z692 300 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 OR8J3Q8NGG0 315 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 MUS81Q96NY9 551 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC106Q9BWC9 280 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 EHD1Q9H4M9 534 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 ABCC6O95255 1503 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 SDHDO14521 159 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 ATG9BQ674R7 924 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 TUBA3EQ6PEY2 450 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 MAN2B1O00754 1011 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 OXTRP30559 389 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 FASLGP48023 281 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 CASP6P55212 293 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 VTCN1Q7Z7D3 282 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 BOCQ9BWV1 1114 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 SOX30O94993 753 aa21.39■■□□□ 1.01
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PTPRM-201ENST00000332175 NTSR1P30989 418 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA0319Q5VV43 1072 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 SMCO3A2RU48 225 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 PORP16435 677 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
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PTPRM-201ENST00000332175 TUBA3CQ13748 450 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 TP53INP2Q8IXH6 220 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 KCNK13Q9HB14 408 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 BPIP17213 487 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 GPR143P51810 404 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 ATP6AP1Q15904 470 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM151BQ8IW70 566 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 CHST14Q8NCH0 376 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 PROKR1Q8TCW9 393 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 POLE4Q9NR33 117 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 MTMR10Q9NXD2 777 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 HRH2P25021 359 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 GGT2P36268 569 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 HK3P52790 923 aa21.38■■□□□ 1.01
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PTPRM-201ENST00000332175 TCEAL3Q969E4 200 aa21.38■■□□□ 1.01
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PTPRM-201ENST00000332175 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
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PTPRM-201ENST00000332175 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 NEIL3Q8TAT5 605 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM64BA6NI03 449 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 SLC35E2BP0CK96 405 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 PGCP20142 388 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 RPS15P62841 145 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 MAB21L1Q13394 359 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 TTC9BQ8N6N2 239 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 CD300LFQ8TDQ1 290 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 SEMA4FO95754 770 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 NSDHLQ15738 373 aa21.38■■□□□ 1.01
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF709Q8N972 641 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 TRIB3Q96RU7 358 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 RXFP3Q9NSD7 469 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 MKLN1Q9UL63 735 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 THEGLP0DJG4 465 aa21.37■■□□□ 1.01
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PTPRM-201ENST00000332175 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.37■■□□□ 1.01
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PTPRM-201ENST00000332175 YES1P07947 543 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
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PTPRM-201ENST00000332175 GCGRP47871 477 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 IST1P53990 364 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF584Q8IVC4 421 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 STOML3Q8TAV4 291 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRM-201ENST00000332175 SGTBQ96EQ0 304 aa21.37■■□□□ 1.01
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