RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 LIPAP38571 399 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 ATAT1Q5SQI0 421 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 KLHL17Q6TDP4 642 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 NLGN4XQ8N0W4 816 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 MFSD4AQ8N468 514 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 TTLQ8NG68 377 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 OR52E1Q8NGJ3 308 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 FAM131CQ96AQ9 280 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 LGALS12Q96DT0 336 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 SLC17A9Q9BYT1 436 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 GLIPR2Q9H4G4 154 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 FZD3Q9NPG1 666 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 INIPQ9NRY2 104 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 TAS2R7Q9NYW3 318 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 ENOPH1Q9UHY7 261 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa16.69■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 EYSQ5T1H1 3165 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 TMEM247A6NEH6 219 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 GLOD5A6NK44 160 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 CLDN24A6NM45 220 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 DRD2P14416 443 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 CDC42P60953 191 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 INAQ16352 499 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 STX19Q8N4C7 294 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 PSMA8Q8TAA3 256 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 SLC38A4Q969I6 547 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 AMDHD1Q96NU7 426 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF607Q96SK3 696 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 PRDM8Q9NQV8 689 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 MS4A12Q9NXJ0 267 aa16.68■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 EFCAB9A8MZ26 197 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 SEMA7AO75326 666 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 STSP08842 583 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 CHMP24386 653 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 POU1F1P28069 291 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 TGFBR1P36897 503 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 TNFRSF4P43489 277 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 DGKEP52429 567 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 TEKQ02763 1124 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 SLC9A5Q14940 896 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 MLC1Q15049 377 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 TIGD6Q17RP2 521 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 TMEM35AQ53FP2 167 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 TCTN3Q6NUS6 607 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 DEF8Q6ZN54 512 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 OR5D16Q8NGK9 328 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 XAGE5Q8WWM1 108 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 COL21A1Q96P44 957 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 FAIM2Q9BWQ8 316 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 OR51I1Q9H343 314 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 ANKHQ9HCJ1 492 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 SEC14L3Q9UDX4 400 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 TMCC3Q9ULS5 477 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 MYO10Q9HD67 2058 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 M0R082 166 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 HAT1O14929 419 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 CD72P21854 359 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 KCNJ5P48544 419 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.265e-7■□□□□ 10.3
SPNS1-202ENST00000323081 CRISP1P54107 249 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 ADPRHP54922 357 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 ST3GAL4Q11206 333 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 SYPL1Q16563 259 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 FRMPD2BQ6IN97 320 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 SLC35G5Q96KT7 338 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF354BQ96LW1 612 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 RMI1Q9H9A7 625 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 SLC6A20Q9NP91 592 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 CLEC1BQ9P126 229 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 P2RX2Q9UBL9 471 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 TRPC4Q9UBN4 977 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 FTSJ1Q9UET6 329 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa16.67■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC88CQ9P219 2028 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 ZAR1LA6NP61 321 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 ERI3O43414 337 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 BMP4P12644 408 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 COL9A1P20849 921 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 NTSR1P30989 418 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 SLAMF1Q13291 335 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-202ENST00000323081 ZIC1Q15915 447 aa16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms