RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd14P10810 366 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acvr2aP27038 513 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Elk4P41158 430 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hif3aQ0VBL6 662 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp1b1Q64429 543 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmeff1Q6PFE7 372 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Oog2Q7TPX8 476 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tex13c3Q810P0 219 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pomt2Q8BGQ4 820 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psmf1Q8BHL8 271 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfm2Q8BM13 448 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf628Q8CJ78 1038 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc38a4Q8R1S9 547 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem150bQ8R218 238 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr109Q8VG96 314 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Commd4Q9CQ02 199 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cxxc1Q9CWW7 660 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 D10Wsu102eQ9CX66 185 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 KelQ9EQF2 713 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rhox2dW4VSN9 191 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp1a2P00186 513 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm527Q4KL13 310 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gata6Q61169 589 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GcgrQ61606 485 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Itih2Q61703 946 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf728Q6P5C7 752 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf770Q8BIQ8 705 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8C3W1 322 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnajc27Q8CFP6 273 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd209eQ91ZW7 208 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aaed1Q9D1A0 226 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ift43Q9DA69 206 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam13cQ9DBR2 601 aa12.25□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Phrf1A6H619 1682 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem235B1AQL3 211 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ctla2bP12400 113 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SmsP97355 366 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd80Q00609 306 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 B3gnt3Q5JCS9 372 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Taar7aQ5QD12 358 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 OgnQ62000 298 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmbim1Q8BJZ3 309 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CenpiQ8K1K4 746 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FbrsQ8R089 466 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zcchc9Q8R1J3 271 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1033Q8VFK5 310 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrgpra5Q91ZC7 304 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Exosc4Q921I9 245 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrps18aQ99N85 196 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Phf6Q9D4J7 364 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Epb41l4bQ9JMC8 527 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc7a7Q9Z1K8 510 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp978A2A7I1 335 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chd5A2A8L1 1946 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vsig10lD3YZF7 868 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nlrp12E9Q5R7 1054 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr237-ps1K9J725 310 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PlaaP27612 794 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PomkQ3TUA9 349 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tlx2Q61663 284 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbxo22Q78JE5 402 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GalpQ810H5 117 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr986Q8VFN6 312 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fank1Q9DAM9 344 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r52Q9EP79 309 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spin2gA0A0N4SW15 236 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1700017D01RikG5E851 209 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spin2eJ3QNQ0 234 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01807 119 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc16a3P57787 470 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AnpepP97449 966 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Coq7P97478 217 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hyal4Q05A56 481 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DbhQ64237 622 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PrlhrQ6VMN6 370 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnk12Q76M80 430 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nfatc4Q8K120 901 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prdm9Q96EQ9 843 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prkar1aQ9DBC7 381 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rhox9Q9EQM5 227 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prmt1Q9JIF0 371 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scn1aA2APX8 2009 aa12.24□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1700014D04RikJ3QMS2 983 aa12.23□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Timp2P25785 220 aa12.23□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdh5P55284 784 aa12.23□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mtf1Q07243 675 aa12.23□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpat2Q14DK4 801 aa12.23□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgap9Q1HDU4 648 aa12.23□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Galk2Q68FH4 458 aa12.23□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ItpkcQ7TS72 678 aa12.23□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mthfd1Q922D8 935 aa12.23□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GnmtQ9QXF8 293 aa12.23□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ClcnkbQ9WUB6 687 aa12.23□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc7a5Q9Z127 512 aa12.23□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm37596A0A0A6YXL2 336 aa12.23□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r34E9PVI0 852 aa12.23□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r37F8VQD3 802 aa12.23□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm6356L7N2A7 188 aa12.23□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nme6O88425 189 aa12.23□□□□□ -0.45
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bmp7P23359 430 aa12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.9 ms