Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Arhgap9Q1HDU4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Arhgap9Q1HDU4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Arhgap9Q1HDU4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Arhgap9Q1HDU4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Arhgap9Q1HDU4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Arhgap9Q1HDU4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Arhgap9Q1HDU4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arhgap9Q1HDU4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Arhgap9Q1HDU4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Arhgap9Q1HDU4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Arhgap9Q1HDU4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgap9Q1HDU4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arhgap9Q1HDU4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Arhgap9Q1HDU4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Arhgap9Q1HDU4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Arhgap9Q1HDU4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgap9Q1HDU4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Arhgap9Q1HDU4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Arhgap9Q1HDU4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Arhgap9Q1HDU4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Arhgap9Q1HDU4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Arhgap9Q1HDU4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Arhgap9Q1HDU4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arhgap9Q1HDU4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Arhgap9Q1HDU4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arhgap9Q1HDU4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Arhgap9Q1HDU4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Arhgap9Q1HDU4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Arhgap9Q1HDU4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Arhgap9Q1HDU4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Arhgap9Q1HDU4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Arhgap9Q1HDU4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Arhgap9Q1HDU4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Arhgap9Q1HDU4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Arhgap9Q1HDU4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Arhgap9Q1HDU4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Arhgap9Q1HDU4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Arhgap9Q1HDU4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgap9Q1HDU4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgap9Q1HDU4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgap9Q1HDU4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgap9Q1HDU4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgap9Q1HDU4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arhgap9Q1HDU4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Arhgap9Q1HDU4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Arhgap9Q1HDU4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Arhgap9Q1HDU4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgap9Q1HDU4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arhgap9Q1HDU4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arhgap9Q1HDU4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arhgap9Q1HDU4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgap9Q1HDU4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arhgap9Q1HDU4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgap9Q1HDU4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgap9Q1HDU4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgap9Q1HDU4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgap9Q1HDU4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgap9Q1HDU4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgap9Q1HDU4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Arhgap9Q1HDU4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arhgap9Q1HDU4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arhgap9Q1HDU4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arhgap9Q1HDU4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arhgap9Q1HDU4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arhgap9Q1HDU4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arhgap9Q1HDU4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgap9Q1HDU4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arhgap9Q1HDU4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arhgap9Q1HDU4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arhgap9Q1HDU4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arhgap9Q1HDU4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgap9Q1HDU4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgap9Q1HDU4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arhgap9Q1HDU4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgap9Q1HDU4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgap9Q1HDU4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgap9Q1HDU4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgap9Q1HDU4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgap9Q1HDU4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arhgap9Q1HDU4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgap9Q1HDU4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgap9Q1HDU4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgap9Q1HDU4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arhgap9Q1HDU4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arhgap9Q1HDU4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arhgap9Q1HDU4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arhgap9Q1HDU4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arhgap9Q1HDU4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arhgap9Q1HDU4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arhgap9Q1HDU4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap9Q1HDU4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arhgap9Q1HDU4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap9Q1HDU4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap9Q1HDU4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap9Q1HDU4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arhgap9Q1HDU4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap9Q1HDU4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap9Q1HDU4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 238.7 ms