RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640577.1

SPIN3-242, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,436 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-242ENST00000640577 OR12D1P0DN82 309 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 CD247P20963 164 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 RYKP34925 604 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 XCR1P46094 333 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 GSTM5P46439 218 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 LSSP48449 732 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 BTN3A2P78410 334 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 GAS6Q14393 721 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 GANABQ14697 944 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 MLC1Q15049 377 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 SYPL1Q16563 259 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 FCRL6Q6DN72 434 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 COMTD1Q86VU5 262 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 SLC5A8Q8N695 610 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 NATD1Q8N6N6 113 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 LZICQ8WZA0 190 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 GPR174Q9BXC1 333 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 KIF17Q9P2E2 1029 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 RHCGQ9UBD6 479 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa14.52□□□□□ -0.08
SPIN3-242ENST00000640577 SPTBP11277 2137 aa14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 OR2A25A4D2G3 310 aa14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 E9PQ18 207 aa14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 SLC1A7O00341 560 aa14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 FFAR1O14842 300 aa14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 PROM1O43490 865 aa14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 PVRP15151 417 aa14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 IL5RAQ01344 420 aa14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 SPIBQ01892 262 aa14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 OR2A5Q96R48 311 aa14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 YIPF4Q9BSR8 244 aa14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 OR51I1Q9H343 314 aa14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 CXorf21Q9HAI6 301 aa14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 ACER3Q9NUN7 267 aa14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 COL6A3P12111 3177 aa14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 A0A0J9YVX5 310 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 GSAPA4D1B5 854 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 PCDH17O14917 1159 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 MFN2O95140 757 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 CHRNB1P11230 501 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 FMO3P31513 532 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 GPC1P35052 558 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 LIM2P55344 173 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 PPP1CAP62136 330 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 ESRRGP62508 458 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 HMGN2P46Q86SG4 172 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 SPARTQ8N0X7 666 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 OR4N4Q8N0Y3 316 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 GPBAR1Q8TDU6 330 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 BBS4Q96RK4 519 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 FANCEQ9HB96 536 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 PTGES3LE9PB15 166 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 KDM1AO60341 852 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 CPNE6O95741 557 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 IGLV3-19P01714 112 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 GLULP15104 373 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 GSTM2P28161 218 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 GSSP48637 474 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 PRKAG1P54619 331 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 NPRL3Q12980 569 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 FZD2Q14332 565 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 KIAA0895LQ68EN5 471 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 SLC48A1Q6P1K1 146 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 ZNF605Q86T29 641 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 OR9Q2Q8NGE9 314 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 OR4D11Q8NGI4 311 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 GIPC3Q8TF64 312 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.51□□□□□ -0.09
SPIN3-242ENST00000640577 ISOC1Q96CN7 298 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms