RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637535.1

CACNB4-256, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5

Gene CACNB4, Length 1,731 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-256	ENST00000637535	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	MYL12A	P19105	171 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	PSMB9	P28065	219 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	CD38	P28907	300 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	SOX6	P35712	828 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	ATP4B	P51164	291 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	GDF10	P55107	478 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	CDH13	P55290	713 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	SPCS3	P61009	180 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	CSNK2B	P67870	215 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	FOXM1	Q08050	763 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	MAMLD1	Q13495	774 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	DPYSL3	Q14195	570 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	LY6D	Q14210	128 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	GPR68	Q15743	365 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	MEP1A	Q16819	746 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	C2CD6	Q53TS8	623 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	RAB41	Q5JT25	222 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	GLYAT	Q6IB77	296 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	GK5	Q6ZS86	529 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	KRT74	Q7RTS7	529 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	OR8H2	Q8N162	312 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	NSMAF	Q92636	917 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	KLK6	Q92876	244 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	C19orf60	Q96EN9	201 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	MBOAT4	Q96T53	435 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	ITPA	Q9BY32	194 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	DYRK4	Q9NR20	520 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	RELN	P78509	3460 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	BSN	Q9UPA5	3926 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535		A0A1W2PPL8	197 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535		G3V2L1	256 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	UBXN8	O00124	270 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	NME4	O00746	187 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	TPP1	O14773	563 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	NPC1	O15118	1278 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	ARPC2	O15144	300 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	SLC16A6	O15403	523 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	NRP2	O60462	931 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	SOX30	O94993	753 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	APOA4	P06727	396 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	CD19	P15391	556 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	CA5A	P35218	305 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	MAGEA3	P43357	314 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	MASP1	P48740	699 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	ATP12A	P54707	1039 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	GABRE	P78334	506 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	GCNT1	Q02742	428 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	PIGF	Q07326	219 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	PUDP	Q08623	228 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	NCF4	Q15080	339 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	TAZ	Q16635	292 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	ADGRF1	Q5T601	910 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	MON1B	Q7L1V2	547 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CACNB4-256	ENST00000637535	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		6.67	□□□□□ -1.34

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