RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559276.5

USP3-212, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 4

Gene USP3, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-212ENST00000559276 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa5.56□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 SYNPO2LQ9H987 977 aa5.56□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 CAB39LQ9H9S4 337 aa5.56□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.56□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 CHRAC1Q9NRG0 131 aa5.56□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 TREX1Q9NSU2 369 aa5.56□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 OR6C2Q9NZP2 312 aa5.56□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa5.56□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa5.56□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 PACSIN3Q9UKS6 424 aa5.56□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 FBXO5Q9UKT4 447 aa5.56□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 ASF1AQ9Y294 204 aa5.56□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 PADI2Q9Y2J8 665 aa5.56□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 TRAF6Q9Y4K3 522 aa5.56□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa5.56□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa5.56□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 DCHS2Q6V1P9 2916 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 ABCA12Q86UK0 2595 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 A0A1W2PP18 115 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 KRT87PA6NCN2 255 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 ANKUB1A6NFN9 424 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 VSTM2BA6NLU5 285 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 IQCF5A8MTL0 148 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 CLDN25C9JDP6 229 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 ARPC2O15144 300 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 SLC22A1O15245 554 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 ACOX3O15254 700 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 CTSVO60911 334 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 EEDO75530 441 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 TIPRLO75663 272 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 ATE1O95260 518 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 JUNP05412 331 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 GSTM1P09488 218 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 PRF1P14222 555 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 LBPP18428 481 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 ATP6V1B2P21281 511 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 S100A1P23297 94 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 MMP11P24347 488 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 NMBRP28336 390 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 GABRB3P28472 473 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 PKLRP30613 574 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 GRK3P35626 688 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 FOLR3P41439 243 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 SLC1A2P43004 574 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 STT3AP46977 705 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 TMED10P49755 219 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 BMXP51813 675 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 TAS2R39P59534 338 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 YBX1P67809 324 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 PRAMEP78395 509 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 PMS2P3Q13401 168 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 RCAN2Q14206 197 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 KIR2DS3Q14952 304 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 OXA1LQ15070 435 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 NKG7Q16617 165 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 TRIM16LQ309B1 348 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 RFX4Q33E94 735 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 CCSMST1Q4G0I0 132 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 CYBRD1Q53TN4 286 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 C1QL3Q5VWW1 255 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 ZNF470Q6ECI4 717 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 NEPROQ6NW34 567 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 CNSTQ6PJW8 725 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 CES3Q6UWW8 571 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 KCTD8Q6ZWB6 473 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 CCDC80Q76M96 950 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 OVCH1Q7RTY7 1134 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 DDIASQ8IXT1 998 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 SLC15A3Q8IY34 581 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 GPR135Q8IZ08 494 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 SLC22A15Q8IZD6 547 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 SVOPLQ8N434 492 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 RNF148Q8N7C7 305 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 CLEC1AQ8NC01 280 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 HMGCLL1Q8TB92 370 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 PSMF1Q92530 271 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 ELMO1Q92556 727 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 HDAC10Q969S8 669 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 SDCCAG3Q96C92 435 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 NXNL1Q96CM4 212 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 LRRC58Q96CX6 371 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 CCDC115Q96NT0 180 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 IP6K3Q96PC2 410 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 IL17FQ96PD4 163 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 CGREF1Q99674 301 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-212ENST00000559276 SLC29A3Q9BZD2 475 aa5.55□□□□□ -1.52
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