RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516016.1

RN7SKP19-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 19, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP19, Length 252 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP19-201ENST00000516016 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 EMC2Q15006 297 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ZNF674Q2M3X9 581 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SPIN3Q5JUX0 258 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 NAA40Q86UY6 237 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ZNF429Q86V71 674 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 KBTBD6Q86V97 674 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CAMKVQ8NCB2 501 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 C8orf46Q8TAG6 207 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SPATA17Q96L03 361 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TRIM7Q9C029 511 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ELOVL4Q9GZR5 314 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 DPEP2Q9H4A9 486 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 UBN1Q9NPG3 1134 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TBC1D7Q9P0N9 293 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 GMEB2Q9UKD1 530 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 NSG2Q9Y328 171 aa0.08□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 A0A1W2PPM1 405 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ZNF732B4DXR9 585 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 OR7A17O14581 309 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CTDSP2O14595 271 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 P2RX6O15547 441 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SUPT7LO94864 414 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 GOT2P00505 430 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 IGHV3-9P01782 118 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 IGHV4-34P06331 123 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 IDSP22304 550 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 COL8A2P25067 703 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TM4SF1P30408 202 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 HSD17B3P37058 310 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SLC1A3P43003 542 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 UNC119Q13432 240 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 GIT2Q14161 759 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SLC17A1Q14916 467 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ABCA11PQ4W5N1 156 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 RAB41Q5JT25 222 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 PLPP4Q5VZY2 271 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 OR52W1Q6IF63 320 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SULT1C3Q6IMI6 304 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 C6orf223Q8N319 242 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SUMF2Q8NBJ7 301 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ZBTB44Q8NCP5 570 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 OR1K1Q8NGR3 316 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CFAP61Q8NHU2 1237 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 DCUN1D4Q92564 292 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 GORASP2Q9H8Y8 452 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 MMP26Q9NRE1 261 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ERVW-1Q9UQF0 538 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CRYL1Q9Y2S2 319 aa0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TRAV18A0A075B6X5 111 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 NKX2-6A6NCS4 301 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 PGRMC2O15173 223 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 AP5Z1O43299 807 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 B4GAT1O43505 415 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 PLOD3O60568 738 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 TIMP1P01033 207 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CALCAP01258 141 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 EEF2P13639 858 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 MYL6BP14649 208 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CALML3P27482 149 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 HOXD10P28358 340 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 CD1BP29016 333 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 PTPN4P29074 926 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 KIR3DL2P43630 455 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 OR3A3P47888 321 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 UCP2P55851 309 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ACTA1P68133 377 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 SULT2A1Q06520 285 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 BIRC3Q13489 604 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 MAMLD1Q13495 774 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 PPA1Q15181 289 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ACER2Q5QJU3 275 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 GALNT17Q6IS24 598 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 ZNF730Q6ZMV8 503 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 C17orf107Q6ZR85 190 aa0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RN7SKP19-201ENST00000516016 AMIGO1Q86WK6 493 aa0.06□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms