RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021278.13

Ctc1-201, Transcript of CST complex subunit CTC1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctc1, Length 4,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1-201ENSMUST00000021278 DbiP31786 87 aa8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Opn1swP51491 346 aa8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ruvbl1P60122 456 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Kcnj3P63250 501 aa8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Scgb1a1Q06318 96 aa8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 1700012B07RikQ3V0S8 276 aa8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Elavl4Q61701 385 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp790Q80ZX2 779 aa8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Msantd1Q8BIL2 278 aa8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mrpl22Q8BU88 206 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mtrf1Q8K126 446 aa8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 SdhaQ8K2B3 664 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Plcz1Q8K4D7 647 aa8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1351Q8VGU6 319 aa8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sfxn5Q925N0 342 aa8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 MpstQ99J99 297 aa8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Acy1Q99JW2 408 aa8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 MINDY3Q9CV28 444 aa8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 GrapQ9CX99 217 aa8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 LhppQ9D7I5 270 aa8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CasrQ9QY96 1079 aa8.91□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm4756A0A140LIS8 335 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Spin2-ps6A0A140T8V2 174 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr74A2BHP6 318 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Wdr76A6PWY4 622 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm9964E9Q9S5 144 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn2r55G3UWZ4 781 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm10324L7N208 604 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rab5cP35278 216 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 P58686 83 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Isl1P61372 349 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Adamts1P97857 968 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pgap2Q3TQR0 254 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tamm41Q3TUH1 337 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dtx4Q6PDK8 616 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Stoml3Q6PE84 287 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cd300lfQ6SJQ7 337 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Il17reQ8BH06 637 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cfap20Q8BTU1 193 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Casp9Q8C3Q9 454 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ago4Q8CJF8 861 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 H1fntQ8CJI4 398 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 H2afjQ8R1M2 129 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hyal1Q91ZJ9 462 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ms4a6bQ99N09 244 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Acbd7Q9D258 88 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Emc7Q9EP72 241 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 SisF8VQM5 1818 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 NynrinQ5DTZ0 1840 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Skint2A7XUX6 400 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cped1B2RX70 1026 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm8126E9Q1N7 198 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm21876F6XK35 94 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 FpgtG5E8F4 590 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Surf2P09926 257 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sbk3P0C5K0 361 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ctbp2P56546 445 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dnaja1P63037 397 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 HgsnatQ3UDW8 656 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ripk1Q60855 656 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp90Q61967 636 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dalrd3Q6PJN8 538 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Znf322Q8BZ89 410 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Emc1Q8C7X2 997 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Wrap53Q8VC51 532 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1466Q8VFW4 310 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Itfg2Q91WI7 443 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tmem150aQ91WN2 271 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lamtor1Q9CQ22 161 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Exo5Q9CXP9 373 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Armc10Q9D0L7 306 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Prl8a8Q9DAS4 241 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hsd17b11Q9EQ06 298 aa8.9□□□□□ -0.98
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp109A0A0U1RPC5 652 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fndc10A2A9Q0 223 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mmp27D3YV89 551 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn2r106E9PY92 862 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gnpda1O88958 289 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 NfyaP23708 346 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ccnd3P30282 292 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 GcgP55095 180 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 RenbpP82343 430 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pdcd1Q02242 288 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sh2d1b2Q45HK4 132 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Scarf1Q5ND28 820 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ift52Q62559 426 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Snx31Q6P8Y7 439 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr859Q7TRF5 309 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q80Y73 168 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tmprss11gQ8BZ10 417 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Abhd11Q8K4F5 307 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn1r203Q8R273 311 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Chrnb4Q8R493 495 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cacng6Q8VHW3 260 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Syt17Q920M7 470 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc5a5Q99PN0 618 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cxxc1Q9CWW7 660 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Elp3Q9CZX0 547 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Chst7Q9EP78 484 aa8.9□□□□□ -0.99
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nme4Q9WV84 186 aa8.9□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.4 ms