RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628883.2

PCBP1-AS1-335, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 891 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ATG4BQ9Y4P1 393 aa9.45□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 FIGNL2A6NMB9 653 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 EFCAB8A8MWE9 144 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 C17orf105B2RV13 164 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CCDC188H7C350 402 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RTCAO00442 366 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 AQP7O14520 342 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 BCKDKO14874 412 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 KLK8O60259 260 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SUSD5O60279 629 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NADKO95544 446 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 IGKV3-11P04433 115 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CELA3AP09093 270 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 GLI4P10075 376 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 GMPRP36959 345 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SLC12A2P55011 1212 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ATP6V0D1P61421 351 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ID2Q02363 134 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PCDH1Q08174 1060 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TGM3Q08188 693 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 STX4Q12846 297 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CHIT1Q13231 466 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 LAPTM5Q13571 262 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MPEG1Q2M385 716 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TMEM35AQ53FP2 167 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PIGGQ5H8A4 983 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PAGE2BQ5JRK9 111 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 OPN5Q6U736 354 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 C9orf40Q8IXQ3 194 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 LAS2Q8IYD9 372 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ACOT4Q8N9L9 421 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TSPAN17Q96FV3 270 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SGCZQ96LD1 299 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SMC6Q96SB8 1091 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RBBP8Q99708 897 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TTYH2Q9BSA4 534 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TBCDQ9BTW9 1192 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CD244Q9BZW8 370 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ROGDIQ9GZN7 287 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SACM1LQ9NTJ5 587 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CD274Q9NZQ7 290 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 FREM3P0C091 2139 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NAV3Q8IVL0 2385 aa9.44□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 A0A0G2JNJ9 132 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 FAM159BA6NKW6 160 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 FGF17O60258 216 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 STMN1P16949 149 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SSTR1P30872 391 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ADH7P40394 386 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 MSH2P43246 934 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 STT3AP46977 705 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 DNASE1L1P49184 302 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RAB10P61026 200 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 IRF8Q02556 426 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 DLG1Q12959 904 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ZNF585AQ6P3V2 769 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 FAM47EQ6ZV65 393 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CYS1Q717R9 158 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 LIX1LQ8IVB5 337 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 BBOF1Q8ND07 529 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 OR7G3Q8NG95 312 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 OR5L2Q8NGL0 311 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NUBPLQ8TB37 319 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PAQR8Q8TEZ7 354 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PYROXD1Q8WU10 500 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 CPNE1Q99829 537 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ZNF559Q9BR84 538 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PROK2Q9HC23 129 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SPRR3Q9UBC9 169 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 COPS7AQ9UBW8 275 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 Q9UFV3 132 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 RNF112Q9ULX5 631 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SNX24Q9Y343 169 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 L3MBTL1Q9Y468 752 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 NINQ8N4C6 2090 aa9.43□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 LRRC3CA6NJW4 275 aa9.42□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 HRKO00198 91 aa9.42□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 PLPP1O14494 284 aa9.42□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.42□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 HCN1O60741 890 aa9.42□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 WDR1O75083 606 aa9.42□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 TGFB1P01137 390 aa9.42□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 P04436 131 aa9.42□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 SLC35E2BP0CK96 405 aa9.42□□□□□ -0.9
PCBP1-AS1-335ENST00000628883 COX7A2P14406 83 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms