RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 PEA15Q15121 130 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FUT10Q6P4F1 479 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SYT13Q7L8C5 426 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MYLIPQ8WY64 445 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CNTNAP1P78357 1384 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KCNQ2O43526 872 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PLATP00750 562 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CDK1P06493 297 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 DLDP09622 509 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GSTM4Q03013 218 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KCNC4Q03721 635 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GAB3Q8WWW8 586 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 WDPCPO95876 746 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ARL16Q0P5N6 197 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MSMO1Q15800 293 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RAB11BQ15907 218 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 METTL4Q8N3J2 472 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SLC19A3Q9BZV2 496 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 APOC3P02656 99 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FNTBP49356 437 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 IRF5Q13568 498 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 HES5Q5TA89 166 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 REEP3Q6NUK4 255 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CD163Q86VB7 1156 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OR2T33Q8NG76 320 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FANK1Q8TC84 345 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 DGAT2Q96PD7 388 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PRRT1Q99946 306 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OR2AG1Q9H205 316 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SRMSQ9H3Y6 488 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FOXO6A8MYZ6 492 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CLDN5O00501 218 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FKTNO75072 461 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PLGLAQ15195 96 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OR10G6Q8NH81 332 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FBXL20Q96IG2 436 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TAS2R39P59534 338 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SLC38A3Q99624 504 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ATG10Q9H0Y0 220 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SLIT2O94813 1529 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PPE2 198 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PQH9 124 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PR64 198 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PRV1 198 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 E7ESA3 106 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PEX12O00623 359 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FABP1P07148 127 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SFTPBP07988 381 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TFPTP0C1Z6 253 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 AMY2BP19961 511 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 EMX2Q04743 252 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OR7G1Q8NGA0 311 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SPTSSAQ969W0 71 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 WDR26Q9H7D7 661 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SOBPA7XYQ1 873 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 J3QLW9 94 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FANCGO15287 622 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PROM1O43490 865 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RHOP08100 348 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF19P17023 458 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KITLGP21583 273 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TLE1Q04724 770 aa6.72□□□□□ -1.33
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