RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 SCELO95171 688 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV3-11P04433 115 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 GABRA1P14867 456 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CD1DP15813 335 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 STT3AP46977 705 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC12A2P55011 1212 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CHIT1Q13231 466 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CEBPEQ15744 281 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A10Q63ZE4 541 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SULT1C3Q6IMI6 304 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SEM1Q6ZVN7 128 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PAQR8Q8TEZ7 354 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC6A15Q9H2J7 730 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CRIM1Q9NZV1 1036 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC3CA6NJW4 275 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC166P0CW27 439 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 KLK2P20151 261 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CPN2P22792 545 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 KIR2DL3P43628 341 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNJ2P63252 427 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 DR1Q01658 176 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 POU4F1Q01851 419 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 IRF8Q02556 426 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 LAPTM5Q13571 262 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PAGE2BQ5JRK9 111 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CDKL4Q5MAI5 379 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPN12Q6ZSI9 719 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PDPRQ8NCN5 879 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A8Q8TCC7 542 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 DGAT2Q96PD7 388 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PROK2Q9HC23 129 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFP64Q9NPA5 681 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 RASSF1Q9NS23 344 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 B4GALT7Q9UBV7 327 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SPACA6W5XKT8 324 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 ITPR3Q14573 2671 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 E7ESA3 106 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SAP18O00422 153 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 TGFB1P01137 390 aa23.61■■□□□ 1.37
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CAPNS1-211ENST00000590874 TBCCQ15814 346 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 ULK2Q8IYT8 1036 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 DOK4Q8TEW6 326 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM31Q9BZY9 425 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CD274Q9NZQ7 290 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 EML6Q6ZMW3 1958 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 UQCRC1P31930 480 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SSR2P43308 183 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 E2F2Q14209 437 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 AP5B1Q2VPB7 878 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM35AQ53FP2 167 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXW8Q8N3Y1 598 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 NAXEQ8NCW5 288 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 BBOF1Q8ND07 529 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 EXT2Q93063 718 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PHACTR1Q9C0D0 580 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 LRATO95237 230 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PCNAP12004 261 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 GMPRP36959 345 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CASP2P42575 452 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V0D1P61421 351 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP2R2AP63151 447 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 LAS2Q8IYD9 372 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBED8Q8IZ13 594 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10G3Q8NGC4 313 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 NEIL3Q8TAT5 605 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXL20Q96IG2 436 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT12Q99456 494 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PRM3Q9NNZ6 103 aa23.59■■□□□ 1.37
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