RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575857.3

SLC12A4-215, Transcript of solute carrier family 12 member 4, human

TSL 3

Gene SLC12A4, Length 588 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC12A4-215	ENST00000575857	CELA2A	P08217	269 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	NR1D1	P20393	614 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	RRAD	P55042	308 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	OR4D2	P58180	307 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	ID2	Q02363	134 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	SLC13A2	Q13183	592 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	ATG16L1	Q676U5	607 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	TANK	Q92844	425 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	C19orf60	Q96EN9	201 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	VPS50	Q96JG6	964 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	EBPL	Q9BY08	206 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	C1orf109	Q9NX04	203 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	HEY2	Q9UBP5	337 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	SPTA1	P02549	2419 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	C1orf226	A1L170	272 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	GUCY1B2	O75343	617 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	SEC22B	O75396	215 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	ATP6AP2	O75787	350 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	GPR75	O95800	540 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	SERPINA7	P05543	415 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	IL3	P08700	152 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	PRR35	P0CG20	571 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	TACR1	P25103	407 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	GSTM5	P46439	218 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	CCL11	P51671	97 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	GPR143	P51810	404 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	HK2	P52789	917 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	SLC26A5	P58743	744 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	TAS2R50	P59544	299 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	FOLH1	Q04609	750 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	SERTAD2	Q14140	314 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	NR6A1	Q15406	480 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	TERF2	Q15554	542 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	GALNT16	Q8N428	558 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	PSMF1	Q92530	271 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	LPAR4	Q99677	370 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	MED4	Q9NPJ6	270 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	SCN2A	Q99250	2005 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857		A8MUA0	341 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857		K7EM74	188 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	DYNC1I1	O14576	645 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	ZNF195	O14628	629 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	SUV39H1	O43463	412 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	PDGFA	P04085	211 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	DRD2	P14416	443 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	SDC1	P18827	310 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	STT3A	P46977	705 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79	4e-7	■■□□□ 11.9
SLC12A4-215	ENST00000575857	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	STX4	Q12846	297 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	KCNAB2	Q13303	367 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	BIK	Q13323	160 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	MYBPC3	Q14896	1274 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SLC12A4-215	ENST00000575857	COLEC12	Q5KU26	742 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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