RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	DDO	Q99489	341 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	PLIN2	Q99541	437 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	DPP3	Q9NY33	737 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	C5AR2	Q9P296	337 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	DEC1	Q9P2X7	70 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080		A0A1W2PPI3	338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080		F8VP50	259 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	CLDN5	O00501	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	AMBP	P02760	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	LIPF	P07098	398 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	OR52Z1	P0C646	297 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	CFC1	P0CG37	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	FGF5	P12034	268 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	GLIPR1	P48060	266 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	TAF10	Q12962	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	KIR2DS3	Q14952	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	IGFBP7	Q16270	282 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	RUFY3	Q7L099	469 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	NECAB1	Q8N987	351 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	SAP25	Q8TEE9	199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	TMCO6	Q96DC7	493 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	VMP1	Q96GC9	406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	ACBD6	Q9BR61	282 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	HGH1	Q9BTY7	390 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	PTPRJ	Q12913	1337 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		4.96	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	NF1	P21359	2839 aa		4.96	□□□□□ -1.61
RBM17-208	ENST00000467080	F8	P00451	2351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080		A0A1W2PR77	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080		K7ENP7	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CACNG3	O60359	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	AVIL	O75366	819 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	IGLV3-19	P01714	112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PIGR	P01833	764 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	IGHV4-34	P06331	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	TPO	P07202	933 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC175	P0C221	793 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	MAGEA11	P43364	429 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SMARCB1	Q12824	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	DLG2	Q15700	870 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM215	Q68D42	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	VPS33A	Q96AX1	596 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	BBS2	Q9BXC9	721 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	ZFHX3	Q15911	3703 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	TRBC2	A0A5B9	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	SDC3	O75056	442 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	GCNT3	O95395	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM17-208	ENST00000467080	RNF224	P0DH78	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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