RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432105.5

PUM2-208, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 584 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-208	ENST00000432105	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	SSX5	O60225	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	HSF2BP	O75031	334 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	MFN2	O95140	757 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	OPN1LW	P04000	364 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	OR52Z1	P0C646	297 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF735	P0CB33	412 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68	3e-8	■■□□□ 13.6
PUM2-208	ENST00000432105	PTPN4	P29074	926 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	CDC25A	P30304	524 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	ARHGDIB	P52566	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	CLDN20	P56880	219 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	MYL6	P60660	151 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	MZT1	Q08AG7	82 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	TRAF2	Q12933	501 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	GNA13	Q14344	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	STK38	Q15208	465 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	USH1G	Q495M9	461 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	ARSK	Q6UWY0	536 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	VPS36	Q86VN1	386 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	TIGD4	Q8IY51	512 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	SPSB1	Q96BD6	273 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	PGM2	Q96G03	612 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	VCX2	Q9H322	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	LY9	Q9HBG7	655 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	MCM3AP	O60318	1980 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105		A0A087WV48	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	CLDN4	O14493	209 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	SOCS2	O14508	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	OGT	O15294	1046 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	GPAA1	O43292	621 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	LRRTM2	O43300	516 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	DNAJB6	O75190	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	SERPINA3	P01011	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	AGT	P01019	485 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	GBA	P04062	536 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	ODC1	P11926	461 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	ITIH1	P19827	911 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	NR1D1	P20393	614 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	CPN2	P22792	545 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	CDC25C	P30307	473 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	ASCL1	P50553	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	NAGLU	P54802	743 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	MTTP	P55157	894 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	RWDD2B	P57060	319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	ARPC4	P59998	168 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	SST	P61278	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	LIPE	Q05469	1076 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	ARHGAP1	Q07960	439 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	PDIA5	Q14554	519 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	CHRNA6	Q15825	494 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PUM2-208	ENST00000432105	AANAT	Q16613	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms