RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 CLEC6AQ6EIG7 209 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ISLR2Q6UXK2 745 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 PAGE2Q7Z2X7 111 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 NUDT13Q86X67 352 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 NUDCD3Q8IVD9 361 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 METTL4Q8N3J2 472 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 CATSPER1Q8NEC5 780 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAJB14Q8TBM8 379 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 M1APQ8TC57 530 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 DOK4Q8TEW6 326 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 TANKQ92844 425 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 PGM2Q96G03 612 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 PKNOX2Q96KN3 472 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 LMF1Q96S06 567 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 CDCP1Q9H5V8 836 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 BRF2Q9HAW0 419 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 LUZP4Q9P127 313 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 C5AR2Q9P296 337 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 PPT2Q9UMR5 302 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 MMACHCQ9Y4U1 282 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.37□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1W2PQ72 361 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 SERTM1A2A2V5 107 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLGA6L10A6NI86 522 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 H3BQF6 201 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC28A2O43868 658 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 FGF17O60258 216 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 NPHS1O60500 1241 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 SEC22BO75396 215 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 MYO1DO94832 1006 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 SEMA3DO95025 777 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 SCELO95171 688 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR75O95800 540 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 CHRNGP07510 517 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00032P0C843 101 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 HSD3B1P14060 373 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 HSD3B2P26439 372 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ALDH9A1P49189 494 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 MAPK12P53778 367 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 TNFRSF17Q02223 184 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 FOLH1Q04609 750 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF33BQ06732 778 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 IMPG1Q17R60 797 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 HHATQ5VTY9 493 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 COMMD6Q7Z4G1 85 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 CUZD1Q86UP6 607 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF2BQ8N4N8 673 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD42Q8N9B4 389 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 AGR3Q8TD06 166 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 TM4SF18Q96CE8 201 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 APIPQ96GX9 242 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ACPTQ9BZG2 426 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR41Q9HAD4 459 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 TMBIM4Q9HC24 238 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 MMP25Q9NPA2 562 aa6.36□□□□□ -1.39
EFTUD2-211ENST00000588374 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms