RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 OR10H1Q9Y4A9 318 aa9.16□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SHROOM3Q8TF72 1996 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 OR6C74A6NCV1 312 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 CDC7O00311 574 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SELENOFO60613 162 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 FGF2P09038 288 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 HBQ1P09105 142 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 PTGFRP43088 359 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 CLDN8P56748 225 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 HSD17B7P56937 341 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 RAB33AQ14088 237 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ST3GAL2Q16842 350 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 NOTUMQ6P988 496 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 UXS1Q8NBZ7 420 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 OR6B3Q8NGW1 331 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 RNF34Q969K3 372 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 DPAGT1Q9H3H5 408 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 UFSP2Q9NUQ7 469 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 GHRLQ9UBU3 117 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 LHX6Q9UPM6 363 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ITGB4P16144 1822 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 BPTFQ12830 3046 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 E9PI62 339 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 GLP2RO95838 553 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 OPN1SWP03999 348 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ACPPP15309 386 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 BMP8BP34820 402 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SPIBQ01892 262 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 TLE2Q04725 743 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 KCNA10Q16322 511 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 CD276Q5ZPR3 534 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SHFQ7M4L6 423 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 CNTN4Q8IWV2 1026 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 TM9SF4Q92544 642 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 KCNJ9Q92806 393 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ZDHHC12Q96GR4 267 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 GAL3ST1Q99999 423 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ABCC13Q9NSE7 274 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 CFAP97Q9P2B7 532 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF225Q9UK10 706 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ARHGEF33A8MVX0 844 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 ARNTLO00327 626 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 ENTPD6O75354 484 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 ECI2O75521 394 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 TFP02787 698 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 IFNA4P05014 189 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 CRYBA1P05813 215 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 CBSLP0DN79 551 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 CXCL2P19875 107 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 CBSP35520 551 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 OR1E2P47887 323 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 RABGGTBP53611 331 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 BTG1P62324 171 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 BCL2L1Q07817 233 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 CAPSQ13938 189 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 SSX2Q16385 188 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF628Q5EBL2 1059 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 RNF149Q8NC42 400 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 OR56A4Q8NGH8 313 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 RFT1Q96AA3 541 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 GSDMCQ9BYG8 508 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 BCO2Q9BYV7 579 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 OR51M1Q9H341 326 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 ANKRD19PQ9H560 264 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 RNF19AQ9NV58 838 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 PTTG3PQ9NZH4 202 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 BTNL2Q9UIR0 455 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 A0A1B0GVI7 797 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 SEC14L5O43304 696 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 TLR5O60602 858 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 RP2O75695 350 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 IL1AP01583 271 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 SLC6A1P30531 599 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 MMP12P39900 470 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 CASP9P55211 416 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 RPS25P62851 125 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 LRRC74AQ0VAA2 488 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 CLINT1Q14677 625 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 NCF4Q15080 339 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF528Q3MIS6 628 aa9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms