RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359751.8

EFNA4-201, Transcript of ephrin A4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFNA4, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4-201ENST00000359751 SCN2AQ99250 2005 aa14.97□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 EEDO75530 441 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 JRKO75564 520 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 SERPINA7P05543 415 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 NR1D1P20393 614 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 HTR6P50406 440 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 HMGCS1Q01581 520 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 BST1Q10588 318 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 PLAG1Q6DJT9 500 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 GALNT16Q8N428 558 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 LRRC8CQ8TDW0 803 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 EXTL1Q92935 676 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 ART5Q96L15 291 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 HBEGFQ99075 208 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 LHPPQ9H008 270 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 MLXIPLQ9NP71 852 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 GPR83Q9NYM4 423 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 EHD3Q9NZN3 535 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 MAPRE3Q9UPY8 281 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.96□□□□□ -0.01
EFNA4-201ENST00000359751 TRPC5OSA6NMA1 111 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 DYNC1I1O14576 645 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 TMPRSS11DO60235 418 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 SEC22BO75396 215 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 CEACAM4O75871 244 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 PIK3R1P27986 724 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 GALNSP34059 522 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 ASMTP46597 345 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 TAS2R50P59544 299 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 KCNAB2Q13303 367 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 MYBPC3Q14896 1274 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 PCOLCEQ15113 449 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 UGT3A2Q3SY77 523 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 SFT2D3Q587I9 215 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 FAM69BQ5VUD6 431 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 OR14A16Q8NHC5 309 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 M1APQ8TC57 530 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 C19orf60Q96EN9 201 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 CSF3RQ99062 836 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 GIMAP4Q9NUV9 329 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 C5AR2Q9P296 337 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 ATG4BQ9Y4P1 393 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 ZZEF1O43149 2961 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 MED13Q9UHV7 2174 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 SPTA1P02549 2419 aa14.95□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 SAGE2PA6NJ88 616 aa14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 PIP5K1BO14986 540 aa14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 SNNO75324 88 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 GPR75O95800 540 aa14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 AIFM1O95831 613 aa14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 MAOAP21397 527 aa14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 ITGA3P26006 1051 aa14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 SERPINB3P29508 390 aa14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 XKR7Q5GH72 579 aa14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 CRLF3Q8IUI8 442 aa14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 ZNF160Q9HCG1 818 aa14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 MMP25Q9NPA2 562 aa14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 MYNNQ9NPC7 610 aa14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.94□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 A0A1W2PR48 441 aa14.93□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 FAM227AF5H4B4 570 aa14.93□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 LSM1O15116 133 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 IFNA16P05015 189 aa14.93□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 LINC00032P0C843 101 aa14.93□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 CHN1P15882 459 aa14.93□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 STT3AP46977 705 aa14.93□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 PGDP52209 483 aa14.93□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 BTG2P78543 158 aa14.93□□□□□ -0.02
EFNA4-201ENST00000359751 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms