RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343017.11

SNX18-202, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

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Gene SNX18, Length 3,140 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-202ENST00000343017 MAPKAPK2P49137 400 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 RGS1Q08116 209 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 CRHR2Q13324 411 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 CPTPQ5TA50 214 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 BCL2L15Q5TBC7 163 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 PIP5K1AQ99755 562 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 MARVELD1Q9BSK0 173 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 LANCL1O43813 399 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 B4GALT3O60512 393 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 PSMA3P25788 255 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 CD79BP40259 229 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 SMSP52788 366 aa14.54□□□□□ -0.08
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SNX18-202ENST00000343017 SCARB2Q14108 478 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 SEC23BQ15437 767 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 KCTD7Q96MP8 289 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 IL26Q9NPH9 171 aa14.54□□□□□ -0.08
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SNX18-202ENST00000343017 FFAR1O14842 300 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 PAHP00439 452 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 ATF6P18850 670 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 CD22P20273 847 aa14.54□□□□□ -0.08
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SNX18-202ENST00000343017 RAB8AP61006 207 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 PCDH1Q08174 1060 aa14.54□□□□□ -0.08
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SNX18-202ENST00000343017 ZNF730Q6ZMV8 503 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
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SNX18-202ENST00000343017 UBTD2Q8WUN7 234 aa14.54□□□□□ -0.08
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SNX18-202ENST00000343017 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa14.54□□□□□ -0.08
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SNX18-202ENST00000343017 HBA1P69905 142 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 RPA4Q13156 261 aa14.53□□□□□ -0.08
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SNX18-202ENST00000343017 ZNF385BQ569K4 471 aa14.53□□□□□ -0.08
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SNX18-202ENST00000343017 NOD1Q9Y239 953 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 CDH10Q9Y6N8 788 aa14.53□□□□□ -0.08
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SNX18-202ENST00000343017 M0QZQ0 153 aa14.53□□□□□ -0.08
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SNX18-202ENST00000343017 FABP5Q01469 135 aa14.53□□□□□ -0.08
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SNX18-202ENST00000343017 NFATC2Q13469 925 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 KLHL22Q53GT1 634 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 VRK3Q8IV63 474 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 TMEM43Q9BTV4 400 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 CRLS1Q9UJA2 301 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 SHISA3A0PJX4 238 aa14.52□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 PITPNM1O00562 1244 aa14.52□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 PROM1O43490 865 aa14.52□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 CHP2O43745 196 aa14.52□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 CXCL3P19876 107 aa14.52□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 LIM2P55344 173 aa14.52□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.52□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 LRRC74AQ0VAA2 488 aa14.52□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 C1DQ13901 141 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 NCF4Q15080 339 aa14.52□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 AANATQ16613 207 aa14.52□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.52□□□□□ -0.08
SNX18-202ENST00000343017 PROKR2Q8NFJ6 384 aa14.52□□□□□ -0.08
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