RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020258.9

Herc4-201, Transcript of Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc4, Length 3,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4-201ENSMUST00000020258 Adam21Q9JI76 729 aa11□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ap3m1Q9JKC8 418 aa11□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Loxl3Q9Z175 754 aa11□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr49Q9Z1V0 313 aa11□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Lama2Q60675 3118 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Trpm6Q8CIR4 2028 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn2r106E9PY92 862 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfp995E9Q6M3 437 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr605E9Q838 314 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Psmb5O55234 264 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cacng1O70578 223 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dsc1P55849 886 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 SobpQ0P5V2 864 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pdss2Q33DR3 401 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ccser2Q3UHI0 833 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Taar8aQ5QD07 344 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Irf4Q64287 450 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Bhlhb9Q6PB60 539 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tas2r140Q7TQA4 312 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mgat4bQ812F8 548 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Txnl4bQ8BUH1 149 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 BC024139Q8BVJ3 772 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Larp4Q8BWW4 719 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Atat1Q8K341 421 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Glcci1Q8K3I9 537 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mapre2Q8R001 326 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 HopxQ8R1H0 73 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Col26a1Q91VF6 440 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Scn5aQ9JJV9 2019 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 CtcflA2APF3 636 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tex16F6WNY1 1150 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ephb6O08644 1014 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Il13ra1O09030 424 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sypl1O09117 261 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cpa3P15089 417 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 DcnP28654 354 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 VaspP70460 375 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cdk18Q04899 451 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ankdd1bQ14DN9 521 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mrpl10Q3TBW2 262 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mup20Q5FW60 181 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Acat3Q80X81 397 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Chrnb3Q8BMN3 464 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zcchc3Q8BPK2 400 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Lrrtm3Q8BZ81 582 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cox10Q8CFY5 443 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 FkrpQ8CG64 494 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 FbrsQ8R089 466 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1263Q8VG63 306 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1346Q8VGH6 313 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Camk1gQ91VB2 477 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Abcg4Q91WA9 646 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Spred2Q924S7 410 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Itgb3bpQ9CQ82 176 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Snx7Q9CY18 387 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ebna1bp2Q9D903 306 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 PrkraQ9WTX2 313 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 H2-BlV9GXR0 257 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfp534A2A7A1 661 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm5938A2AEN9 163 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm5072A2AHM1 344 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm14295A2BG91 834 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Pgbd5D3YZI9 523 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc6a2O55192 617 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Bard1O70445 765 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Hoxc8P09025 242 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cab39Q06138 341 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Lrrc75bQ7TPD7 306 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Slc6a17Q8BJI1 727 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mon1bQ8BMQ8 553 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tmsb15lQ8C0W0 80 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 EndovQ8C9A2 338 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Irak2Q8CFA1 622 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 LzicQ8K3C3 190 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr441Q8VFS5 310 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cadm3Q99N28 396 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tvp23bQ9D8T4 205 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Xylt2Q9EPL0 865 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Unc80Q8BLN6 3261 aa10.99□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Dock1Q8BUR4 1865 aa10.98□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm43796A0A0J9YV32 372 aa10.98□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm33543A0A1B0GSI5 81 aa10.98□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm6710A2ART0 554 aa10.98□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr287E9PZS7 322 aa10.98□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn2r115E9Q0E7 857 aa10.98□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm14139F6ZS36 494 aa10.98□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr631F8VPJ9 319 aa10.98□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Arfip1G5E8V9 373 aa10.98□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 ClppO88696 272 aa10.98□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 ItgamP05555 1153 aa10.98□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cav3P51637 151 aa10.98□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Kcnj8P97794 424 aa10.98□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tgtp2Q3T9E4 415 aa10.98□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tbc1d24Q3UUG6 561 aa10.98□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Elmod1Q3V1U8 326 aa10.98□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tgtp1Q62293 415 aa10.98□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1322Q7TQW3 310 aa10.98□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Nup107Q8BH74 926 aa10.98□□□□□ -0.65
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ubr7Q8BU04 425 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52.9 ms