Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG64

Fkrp, Fukutin-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FkrpQ8CG64 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
FkrpQ8CG64 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FkrpQ8CG64 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FkrpQ8CG64 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FkrpQ8CG64 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FkrpQ8CG64 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
FkrpQ8CG64 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FkrpQ8CG64 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FkrpQ8CG64 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FkrpQ8CG64 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FkrpQ8CG64 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FkrpQ8CG64 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FkrpQ8CG64 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FkrpQ8CG64 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FkrpQ8CG64 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FkrpQ8CG64 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FkrpQ8CG64 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FkrpQ8CG64 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FkrpQ8CG64 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FkrpQ8CG64 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FkrpQ8CG64 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FkrpQ8CG64 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FkrpQ8CG64 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FkrpQ8CG64 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FkrpQ8CG64 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FkrpQ8CG64 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FkrpQ8CG64 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FkrpQ8CG64 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FkrpQ8CG64 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FkrpQ8CG64 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FkrpQ8CG64 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FkrpQ8CG64 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FkrpQ8CG64 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FkrpQ8CG64 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FkrpQ8CG64 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FkrpQ8CG64 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FkrpQ8CG64 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FkrpQ8CG64 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FkrpQ8CG64 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FkrpQ8CG64 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FkrpQ8CG64 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FkrpQ8CG64 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FkrpQ8CG64 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FkrpQ8CG64 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FkrpQ8CG64 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FkrpQ8CG64 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FkrpQ8CG64 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FkrpQ8CG64 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FkrpQ8CG64 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FkrpQ8CG64 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FkrpQ8CG64 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FkrpQ8CG64 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FkrpQ8CG64 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FkrpQ8CG64 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FkrpQ8CG64 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FkrpQ8CG64 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FkrpQ8CG64 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FkrpQ8CG64 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FkrpQ8CG64 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FkrpQ8CG64 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FkrpQ8CG64 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FkrpQ8CG64 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FkrpQ8CG64 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FkrpQ8CG64 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FkrpQ8CG64 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FkrpQ8CG64 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FkrpQ8CG64 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FkrpQ8CG64 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FkrpQ8CG64 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FkrpQ8CG64 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FkrpQ8CG64 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FkrpQ8CG64 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FkrpQ8CG64 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FkrpQ8CG64 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FkrpQ8CG64 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FkrpQ8CG64 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FkrpQ8CG64 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FkrpQ8CG64 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FkrpQ8CG64 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FkrpQ8CG64 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FkrpQ8CG64 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FkrpQ8CG64 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FkrpQ8CG64 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FkrpQ8CG64 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FkrpQ8CG64 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FkrpQ8CG64 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FkrpQ8CG64 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FkrpQ8CG64 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FkrpQ8CG64 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FkrpQ8CG64 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FkrpQ8CG64 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FkrpQ8CG64 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FkrpQ8CG64 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FkrpQ8CG64 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FkrpQ8CG64 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FkrpQ8CG64 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FkrpQ8CG64 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FkrpQ8CG64 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FkrpQ8CG64 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FkrpQ8CG64 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms