RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587934.1

GIPC1-208, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 330 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-208ENST00000587934 KRT87PA6NCN2 255 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 A8MVJ9 347 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 J3KR12 359 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 PCDHGA12O60330 932 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 ICMTO60725 284 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 KAT7O95251 611 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 ZNF682O95780 498 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 APODP05090 189 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 ALPPP05187 535 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 HLA-EP13747 358 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 ACPPP15309 386 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 GABRG2P18507 467 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 MAGP20916 626 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 MAOBP27338 520 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 HLA-DMAP28067 261 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 IFNA8P32881 189 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 PIK3CGP48736 1102 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 RGS6P49758 472 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 CLDN8P56748 225 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 RPS14P62263 151 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 PLIN5Q00G26 463 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 SLC10A7Q0GE19 358 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 ZNF235Q14590 738 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 PTPRNQ16849 979 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 GTDC1Q4AE62 458 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 CCDC157Q569K6 752 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 PIK3R6Q5UE93 754 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 LRRC66Q68CR7 880 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 NEK5Q6P3R8 708 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 FAM171BQ6P995 826 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 CBLL1Q75N03 491 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 GPR155Q7Z3F1 870 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 LRRTM3Q86VH5 581 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 C12orf40Q86WS4 652 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 GATAD2AQ86YP4 633 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 ZZZ3Q8IYH5 903 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 ZNF683Q8IZ20 524 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 VWA5B2Q8N398 1253 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 STX19Q8N4C7 294 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 DENND6BQ8NEG7 585 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 ZFAND1Q8TCF1 268 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 CD200R1Q8TD46 325 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 KCNJ9Q92806 393 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 GGHQ92820 318 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 MARVELD3Q96A59 401 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 SEMA3CQ99985 751 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 RHNO1Q9BSD3 238 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 OR51E2Q9H255 320 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 RUBCNLQ9H714 662 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 ENOPH1Q9UHY7 261 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 ABCG2Q9UNQ0 655 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 MAPRE3Q9UPY8 281 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 POFUT2Q9Y2G5 429 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 U3KQV3 271 aa9.09□□□□□ -0.95
GIPC1-208ENST00000587934 NUMA1Q14980 2115 aa9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 SH3D21A4FU49 640 aa9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 KIAA0513O60268 411 aa9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 PDE9AO76083 593 aa9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 ESR1P03372 595 aa9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 CYP17A1P05093 508 aa9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 EBLN1P0CF75 366 aa9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 ANXA8P13928 327 aa9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 GNSP15586 552 aa9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 GRK5P34947 590 aa9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 SLC19A1P41440 591 aa9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 MAPKAPK2P49137 400 aa9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 SCN1BQ07699 218 aa9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 ABRAXAS2Q15018 415 aa9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 VMACQ2NL98 169 aa9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 GPAT3Q53EU6 434 aa9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 FBXO48Q5FWF7 155 aa9.08□□□□□ -0.96
GIPC1-208ENST00000587934 WDR45BQ5MNZ6 344 aa9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms