RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538433.5

PPFIBP1-208, Transcript of PPFIA binding protein 1, human

TSL 3

Gene PPFIBP1, Length 609 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ADRA1A	P35348	466 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PTGFR	P43088	359 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	IER3	P46695	156 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SLC1A6	P48664	564 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	AIF1	P55008	147 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KRTAP10-3	P60369	221 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	IRX4	P78413	519 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CX3CL1	P78423	397 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CACNG1	Q06432	222 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SLC1A5	Q15758	541 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	STXBP2	Q15833	593 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GPR33	Q49SQ1	333 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GPAT3	Q53EU6	434 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LIPJ	Q5W064	366 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TRNP1	Q6NT89	227 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FUT10	Q6P4F1	479 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LUZP1	Q86V48	1076 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	WDR49	Q8IV35	697 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RDM1	Q8NG50	284 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GPR148	Q8TDV2	347 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GANC	Q8TET4	914 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SEPT8	Q92599	483 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	OSTF1	Q92882	214 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TSSK2	Q96PF2	358 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZNF607	Q96SK3	696 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PSD2	Q9BQI7	771 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	YY1AP1	Q9H869	796 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RAB18	Q9NP72	206 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RAI14	Q9P0K7	980 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	POMT2	Q9UKY4	750 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	OR1A2	Q9Y585	309 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433		R4GN57	208 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433		U3KQV3	271 aa		2.55	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	WDR81	Q562E7	1941 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PFAS	O15067	1338 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SNURFL	B1AK76	121 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZNF732	B4DXR9	585 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433		H3BMH7	237 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DVL1	O14640	695 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KLF11	O14901	512 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	OGT	O15294	1046 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CLDN3	O15551	220 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ECE2	O60344	883 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CS	O75390	466 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NEBL	O76041	1014 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	OR6A2	O95222	327 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SYNGR4	O95473	234 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CPNE6	O95741	557 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	EPO	P01588	193 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	IGHE	P01854	428 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	OPN1MW	P04001	364 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ASNS	P08243	561 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SFTPC	P11686	197 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	HLA-DOB	P13765	273 aa		2.54	□□□□□ -2
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NCK1	P16333	377 aa		2.54	□□□□□ -2

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