RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 RNF165Q6ZSG1 346 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 KCTD8Q6ZWB6 473 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CALHM3Q86XJ0 350 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 EID3Q8N140 333 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PYURFQ96I23 114 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 COQ10AQ96MF6 247 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 FAM129BQ96TA1 746 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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HERC4-211ENST00000492996 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.7□□□□□ -1.34
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HERC4-211ENST00000492996 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MYO10Q9HD67 2058 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PTGES3LE9PB15 166 aa6.69□□□□□ -1.34
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HERC4-211ENST00000492996 PCDH8O95206 1070 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 NPPBP16860 134 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ITGB7P26010 798 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CD6P30203 668 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 S100A5P33763 92 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CYP4F2P78329 520 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RAE1P78406 368 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CTBSQ01459 385 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 GRHL2Q6ISB3 625 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MED27Q6P2C8 311 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ELMOD2Q8IZ81 293 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OR56A3Q8NH54 315 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 VPS35Q96QK1 796 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CTRCQ99895 268 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CXorf21Q9HAI6 301 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RAD18Q9NS91 495 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PRSS23O95084 383 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 BMP10O95393 424 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OPN1SWP03999 348 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PCCBP05166 539 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 AGXTP21549 392 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 IL12RB1P42701 662 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 E2F1Q01094 437 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CNTN1Q12860 1018 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 VMACQ2NL98 169 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CEP78Q5JTW2 689 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TMEM26Q6ZUK4 368 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CEP68Q76N32 757 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MMP21Q8N119 569 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 FLCNQ8NFG4 579 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OR5AR1Q8NGP9 310 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 BAG5Q9UL15 447 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 H0YIV9 168 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 H3BUI4 141 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MAN1A2O60476 641 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 KAT7O95251 611 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ACPPP15309 386 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TNFRSF1BP20333 461 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 C5AR1P21730 350 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PRPH2P23942 346 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 KDELR2P33947 212 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PTGS2P35354 604 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CRATP43155 626 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 UCNP55089 124 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 VLDLRP98155 873 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TAP2Q03519 686 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ELP6Q0PNE2 266 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 GAB1Q13480 694 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RAB39AQ14964 217 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZNF385BQ569K4 471 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 USP51Q70EK9 711 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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