RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489571.5

PGAP2-223, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 2

Gene PGAP2, Length 879 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-223	ENST00000489571	SCEL	O95171	688 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	IFNA16	P05015	189 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	C2	P06681	752 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	EPB42	P16452	691 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	SERPINB1	P30740	379 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	SSR4	P51571	173 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	GHDC	Q8N2G8	530 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	TMEM156	Q8N614	296 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	OR7G3	Q8NG95	312 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	CCDC77	Q9BR77	488 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	SNX15	Q9NRS6	342 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	TACC2	O95359	2948 aa		14.7	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	CCDC189	A1A4V9	331 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	SH3BGRL	O75368	114 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	TGFB1	P01137	390 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	SSR2	P43308	183 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	MEOX1	P50221	254 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	STX4	Q12846	297 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	SETDB1	Q15047	1291 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	CHSY3	Q70JA7	882 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	SULF2	Q8IWU5	870 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	TEX9	Q8N6V9	391 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	MORN4	Q8NDC4	146 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	MARVELD3	Q96A59	401 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	SPACA6	W5XKT8	324 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	NIN	Q8N4C6	2090 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	FBN2	P35556	2912 aa		14.69	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571		A0A096LPK6	155 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	PEX1	O43933	1283 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	LDB3	O75112	727 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	KLHL2	O95198	593 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	GFAP	P14136	432 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	ABO	P16442	354 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	PHB	P35232	272 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	SERPINB8	P50452	374 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	HSF1	Q00613	529 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	ID2	Q02363	134 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	SERTAD2	Q14140	314 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	ACAP2	Q15057	778 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	MDGA2	Q7Z553	956 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	OR51B5	Q9H339	312 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	MYOT	Q9UBF9	498 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571		A8MVJ9	347 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	C17orf105	B2RV13	164 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNHIT1	O43257	154 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	KLK8	O60259	260 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	OR2J2	O76002	312 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
PGAP2-223	ENST00000489571	FREM3	P0C091	2139 aa		14.67	□□□□□ -0.06

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