RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 ITGA2P17301 1181 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PDHA2P29803 388 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK5Q00535 292 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS6KA2Q15349 733 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR65Q8IYL9 337 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LGI4Q8N135 537 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4K1Q8NGD4 311 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NEURL3Q96EH8 262 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRE3Q9BY15 652 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ATG10Q9H0Y0 220 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MVB12BQ9H7P6 319 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MYNNQ9NPC7 610 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ACSL6Q9UKU0 697 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ARID1AO14497 2285 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CNR2P34972 360 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SPAM1P38567 509 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MC1RQ01726 317 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GTF2H3Q13889 308 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB33AQ14088 237 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CARTPTQ16568 116 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GRHL2Q6ISB3 625 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF18BQ86Y91 864 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD53Q8N9V6 530 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC38A5Q8WUX1 472 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SELENOMQ8WWX9 145 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DIO2Q92813 273 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A46Q96AG3 418 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MTERF3Q96E29 417 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MARVELD1Q9BSK0 173 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJC11Q9NVH1 559 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KCTD5Q9NXV2 234 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAH14Q0VDD8 3507 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NCOR1O75376 2440 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SH3D21A4FU49 640 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RHOCP08134 193 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZGLP1P0C6A0 271 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMB9P28065 219 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1D2P34982 312 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP3K8P41279 467 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GJA8P48165 433 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNJ5P48544 419 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf27AQ580R0 203 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MFSD4BQ5TF39 518 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CACHD1Q5VU97 1274 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LIPJQ5W064 366 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF730Q6ZMV8 503 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CHFRQ96EP1 664 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PANX1Q96RD7 426 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TAAR2Q9P1P5 351 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PEX16Q9Y5Y5 336 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SPEGQ15772 3267 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZW10O43264 779 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GUCA1CO95843 209 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ANXA5P08758 320 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 S100A1P23297 94 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 BSGP35613 385 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TMED10P49755 219 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ITKQ08881 620 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CEBPEQ15744 281 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DNM1P46Q6ZS02 220 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GLRX5Q86SX6 157 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 BBS7Q8IWZ6 715 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HS6ST3Q8IZP7 471 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HTRA1Q92743 480 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PIP5K1AQ99755 562 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SARGQ9BW04 601 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC6A16Q9GZN6 736 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC68Q9H2F9 335 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 BRF2Q9HAW0 419 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FZD4Q9ULV1 537 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAMDEC1O15204 470 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MTX2O75431 263 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ITGALP20701 1170 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS5P46782 204 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
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