RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329286.6

RAB12-201, Transcript of RAB12, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB12, Length 2,137 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12-201ENST00000329286 SEMA3DO95025 777 aa29.62■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 PTHP01270 115 aa29.62■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 POU2F1P14859 743 aa29.62■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 ST3GAL4Q11206 333 aa29.62■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 SAXO2Q658L1 398 aa29.62■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa29.62■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 AQP11Q8NBQ7 271 aa29.62■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 RHBGQ9H310 441 aa29.62■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 SLAMF7Q9NQ25 335 aa29.62■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 SPATA7Q9P0W8 599 aa29.62■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 SLC6A14Q9UN76 642 aa29.62■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 SNX8Q9Y5X2 465 aa29.62■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa29.61■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 ERGP11308 486 aa29.61■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 GRK5P34947 590 aa29.61■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 CDC42P60953 191 aa29.61■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 TMEM52BQ4KMG9 183 aa29.61■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 ZNF697Q5TEC3 545 aa29.61■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 FAM180BQ6P0A1 224 aa29.61■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 CEACAM20Q6UY09 585 aa29.61■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa29.61■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 ITPKCQ96DU7 683 aa29.61■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 RSPRY1Q96DX4 576 aa29.61■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 MS4A12Q9NXJ0 267 aa29.61■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 ZAR1LA6NP61 321 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 TBX19O60806 448 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 CD40LGP29965 261 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 CTNNB1P35222 781 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 LIMK1P53667 647 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 KLHL17Q6TDP4 642 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 ACAT2Q9BWD1 397 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 A4GALTQ9NPC4 353 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 A3GALT2U3KPV4 340 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 ADAM23O75077 832 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 DEPDC1Q5TB30 811 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 HORMAD2Q8N7B1 307 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 B3GNT7Q8NFL0 401 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 PSMA8Q8TAA3 256 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 SPPL3Q8TCT6 385 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 OR5P2Q8WZ92 322 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 CRELD1Q96HD1 420 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 IL23AQ9NPF7 189 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 PRDM8Q9NQV8 689 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 PRKAB1Q9Y478 270 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 GASTP01350 101 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 RPA4Q13156 261 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 CBX3Q13185 183 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 ITFG2Q969R8 447 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 MS4A8Q9BY19 250 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 PELI2Q9HAT8 420 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 RHCGQ9UBD6 479 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 DENND4AQ7Z401 1863 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 FFAR1O14842 300 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 TLL1O43897 1013 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 CHMP24386 653 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 BSGP35613 385 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 BMPR1AP36894 532 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 SLC6A11P48066 632 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 MAPK12P53778 367 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 LIM2P55344 173 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 C17orf64Q86WR6 236 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 ANKRD53Q8N9V6 530 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 SLC38A5Q8WUX1 472 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 TM4SF18Q96CE8 201 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 TAC3Q9UHF0 121 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 SH3D21A4FU49 640 aa29.58■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 RPS26P62854 115 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 ARMCX4Q5H9R4 360 aa29.58■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 COX14Q96I36 57 aa29.58■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 DSPPQ9NZW4 1301 aa29.58■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 MYO7AQ13402 2215 aa29.58■■■□□ 2.33
RAB12-201ENST00000329286 ANKDD1BA6NHY2 528 aa29.57■■■□□ 2.32
RAB12-201ENST00000329286 RTCAO00442 366 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
RAB12-201ENST00000329286 MPZL2O60487 215 aa29.57■■■□□ 2.32
RAB12-201ENST00000329286 BCHEP06276 602 aa29.57■■■□□ 2.32
RAB12-201ENST00000329286 RGS6P49758 472 aa29.57■■■□□ 2.32
RAB12-201ENST00000329286 CRISP1P54107 249 aa29.57■■■□□ 2.32
RAB12-201ENST00000329286 OLR1P78380 273 aa29.57■■■□□ 2.32
RAB12-201ENST00000329286 COLEC12Q5KU26 742 aa29.57■■■□□ 2.32
RAB12-201ENST00000329286 ZNF367Q7RTV3 350 aa29.57■■■□□ 2.32
RAB12-201ENST00000329286 TAGAPQ8N103 731 aa29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 530.3 ms