RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293230.9

CYGB-201, Transcript of cytoglobin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYGB, Length 2,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYGB-201ENST00000293230 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa18.46■□□□□ 0.55
CYGB-201ENST00000293230 TESMINQ9Y4I5 508 aa18.46■□□□□ 0.55
CYGB-201ENST00000293230 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CYGB-201ENST00000293230 DPM1O60762 260 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 ANGPTL1O95841 491 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 ADH1BP00325 375 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 CD247P20963 164 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 PRIM2P49643 509 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 ENTPD1P49961 510 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 CCR8P51685 355 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 REEP5Q00765 189 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 FADDQ13158 208 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 ZNF566Q969W8 418 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 C12orf66Q96MD2 445 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 XKR8Q9H6D3 395 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 KCNK6Q9Y257 313 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 GMPPBQ9Y5P6 360 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 M0QX08 132 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 CCDC159P0C7I6 412 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 MAPK12P53778 367 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 PLA2G16P53816 162 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 TRIM40Q6P9F5 258 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 TM4SF18Q96CE8 201 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 NODALQ96S42 347 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 RHNO1Q9BSD3 238 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 EPS8L2Q9H6S3 715 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa18.45■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 K7EQS6 105 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 SEMA3DO95025 777 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 DDCP20711 480 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 PCMT1P22061 227 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 HSD17B2P37059 387 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 CDK6Q00534 326 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 RBBP4Q09028 425 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 HYAL1Q12794 435 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 SETD9Q8NE22 299 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 UBE2FQ969M7 185 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 FERD3LQ96RJ6 166 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 DGCR6LQ9BY27 220 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 AHSPQ9NZD4 102 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 ICKQ9UPZ9 632 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 SNX8Q9Y5X2 465 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 A0A1W2PPC1 479 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 ALDH9A1P49189 494 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 RPS26P62854 115 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 FAM20CQ8IXL6 584 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 AMER3Q8N944 861 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 CSF3RQ99062 836 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 ACSL5Q9ULC5 683 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa18.44■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 SCAMP1O15126 338 aa18.43■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 PPM1DO15297 605 aa18.43■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 TMPRSS11DO60235 418 aa18.43■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 TUBA3CQ13748 450 aa18.43■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 NR1D2Q14995 579 aa18.43■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 IFI44LQ53G44 452 aa18.43■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa18.43■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 UBE3DQ7Z6J8 389 aa18.43■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 MUL1Q969V5 352 aa18.43■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 CCDC90BQ9GZT6 254 aa18.43■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 FZD3Q9NPG1 666 aa18.43■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 TMEM9Q9P0T7 183 aa18.43■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 SNX11Q9Y5W9 270 aa18.43■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 A0A0G2JN53 185 aa18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 E9PQ18 207 aa18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 OR1F1O43749 312 aa18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 INMTO95050 263 aa18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 CEACAM5P06731 702 aa18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 ARAFP10398 606 aa18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 CXCR2P25025 360 aa18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 GSSP48637 474 aa18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 TMBIM6P55061 237 aa18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 CSNK1G2P78368 415 aa18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 NPRL3Q12980 569 aa18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 CLCA4Q14CN2 919 aa18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 CENPSQ8N2Z9 138 aa18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 OR52J3Q8NH60 311 aa18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 CHPT1Q8WUD6 406 aa18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 UCN3Q969E3 161 aa18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 PCBD2Q9H0N5 130 aa18.42■□□□□ 0.54
CYGB-201ENST00000293230 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms