RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 KLHL28Q9NXS3 571 aa10.16□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa10.16□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 GMPPBQ9Y5P6 360 aa10.16□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 LRRK1Q38SD2 2015 aa10.16□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 hCG_2039718K7EN88 272 aa10.16□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 SOCS2O14508 198 aa10.16□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 MFN2O95140 757 aa10.16□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 IL3P08700 152 aa10.16□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 OCA2Q04671 838 aa10.16□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 HYAL1Q12794 435 aa10.16□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 HSPB3Q12988 150 aa10.16□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 CLECL1Q8IZS7 167 aa10.16□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa10.16□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 FZD3Q9NPG1 666 aa10.16□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa10.16□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 HPRP00739 348 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 GSTM5P46439 218 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 SMIM11AP58511 58 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 SPIBQ01892 262 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 RASSF5Q8WWW0 418 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF347Q96SE7 839 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 DMTF1Q9Y222 760 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 LINC01565O15544 149 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 ERI3O43414 337 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 NUDT14O95848 222 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 TNFP01375 233 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 OLR1P78380 273 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 STK11Q15831 433 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 METRNLQ641Q3 311 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 CITED4Q96RK1 184 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 SLC29A1Q99808 456 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 MYNNQ9NPC7 610 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 FKBP14Q9NWM8 211 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 UCKL1Q9NWZ5 548 aa10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PRRX1-201ENST00000239461 H0YAE9 185 aa10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 SLC28A2O43868 658 aa10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 WBP4O75554 376 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 CTHP32929 405 aa10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 NUP107P57740 925 aa10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 DSTNP60981 165 aa10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM35AQ53FP2 167 aa10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 COLEC12Q5KU26 742 aa10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 OFCC1Q8IZS5 231 aa10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 OR5P2Q8WZ92 322 aa10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 NCSTNQ92542 709 aa10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 FGF14Q92915 247 aa10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 TRIM63Q969Q1 353 aa10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 F2RL3Q96RI0 385 aa10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF696Q9H7X3 374 aa10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 TM9SF3Q9HD45 589 aa10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 CKAP5Q14008 2032 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 GABRR3A8MPY1 467 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 IL9P15248 144 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 UQCRC2P22695 453 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 CDK6Q00534 326 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 TRIM61Q5EBN2 209 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 DEPDC1Q5TB30 811 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 CPZQ66K79 652 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 MFSD2AQ8NA29 543 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 OR4E2Q8NGC2 313 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 WDR20Q8TBZ3 569 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 HSH2DQ96JZ2 352 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 SGPP1Q9BX95 441 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 GSDMCQ9BYG8 508 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM184CQ9NVA4 438 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 DGKBQ9Y6T7 804 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 SERTM1A2A2V5 107 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 A6NHS1 94 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 TNFRSF11BO00300 401 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 BCKDKO14874 412 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 GPR37L1O60883 481 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 VEZF1Q14119 521 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 NEDD8Q15843 81 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 FGD3Q5JSP0 725 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 LRIF1Q5T3J3 769 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 AGBL4Q5VU57 503 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 ENPP6Q6UWR7 440 aa10.14□□□□□ -0.79
PRRX1-201ENST00000239461 STX12Q86Y82 276 aa10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms