RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 BEX2Q9BXY8 128 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 BEX1Q9HBH7 125 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 ERVK-18Q9QC07 812 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 HCKP08631 526 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 STT3AP46977 705 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 RGS19P49795 217 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 GPM6BQ13491 265 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 SPIN3Q5JUX0 258 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 MEDAGQ5VYS4 303 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 IFNL1Q8IU54 200 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 OR2B3O76000 313 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 ITGA5P08648 1049 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 GINS1Q14691 196 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 GXYLT1Q4G148 440 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 C17orf62Q9BQA9 187 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 LEFTY2O00292 366 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 HPRP00739 348 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 HTR2BP41595 481 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 LIPJQ5W064 366 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 OR5M3Q8NGP4 307 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 ORAI3Q9BRQ5 295 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 TAS2R10Q9NYW0 307 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 WDR45Q9Y484 360 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 PLGP00747 810 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 RAB5BP61020 215 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 SHISA4Q96DD7 197 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 MOCOSQ96EN8 888 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 MCHR1Q99705 422 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 CDH10Q9Y6N8 788 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 HTR1EP28566 365 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 LSAMPQ13449 338 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 UNC50Q53HI1 259 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 KCTD9Q7L273 389 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM5Q9Y2B1 443 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 CAPN14A8MX76 684 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 PTGR1Q14914 329 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 RASGRP3Q8IV61 690 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 AP1S3Q96PC3 154 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 INSL5Q9Y5Q6 135 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 LRRN3E7EW58 273 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 EPOP01588 193 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 CKMT1AP12532 417 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 GP1BBP13224 206 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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PTPRM-211ENST00000580170 OR51G2Q8NGK0 314 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 LRRN3Q9H3W5 708 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PQY0 241 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 ID2Q02363 134 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 KCNC4Q03721 635 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 AADACL4Q5VUY2 407 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 BBS10Q8TAM1 723 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 TCHHQ07283 1943 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 CBLP22681 906 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 MAGEA11P43364 429 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 BIRC8Q96P09 236 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 EEDO75530 441 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 OR8S1Q8NH09 359 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 TCEAL4Q96EI5 215 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 ACTL8Q9H568 366 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 LTN1O94822 1766 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 FLRT2O43155 660 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 AOC2O75106 756 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 PLATP00750 562 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 HNF1BP35680 557 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 CPED1A4D0V7 1026 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 APOC3P02656 99 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 OR12D1P0DN82 309 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 AGXTP21549 392 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 EDNRBP24530 442 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 ZFAND4Q86XD8 727 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 MFSD2AQ8NA29 543 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 MOAP1Q96BY2 351 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 DOHHQ9BU89 302 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 A8MU76 341 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 E7ESA3 106 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 PRKACAP17612 351 aa20.54■□□□□ 0.88
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