RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	ALOX15B	O15296	676 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC16A5	O15375	505 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	YKT6	O15498	198 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMD3	O43242	534 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	SPINT2	O43291	252 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	DCX	O43602	365 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	FCMR	O60667	390 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	LRP3	O75074	770 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4F21	O95013	312 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	PIGN	O95427	931 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	BAG3	O95817	575 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	SERPINA3	P01011	423 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	LDLR	P01130	860 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	NPPA	P01160	153 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT6A	P02538	564 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	MT-ND1	P03886	318 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	UGT2B4	P06133	528 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	HMBS	P08397	361 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	GP9	P14770	177 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF44	P15621	663 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRNB2	P17787	502 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKACB	P22694	351 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	PRDX6	P30041	224 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	NF2	P35240	595 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM23	P36406	574 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGEA1	P43355	309 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ART1	P52961	327 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	TMPRSS3	P57727	454 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ZP1	P60852	638 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	MYBPC1	Q00872	1141 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	CACNG1	Q06432	222 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC3A1	Q07837	685 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE2V1	Q13404	147 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	CARTPT	Q16568	116 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	PCK2	Q16822	640 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB6C	Q53S08	254 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	SYT14P1	Q58G82	188 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	FSCB	Q5H9T9	825 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	GRTP1	Q5TC63	336 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	CARD17	Q5XLA6	110 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS36	Q86VN1	386 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	PAQR7	Q86WK9	346 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	TDH	Q8IZJ6	230 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	BEST3	Q8N1M1	668 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	COMMD1	Q8N668	190 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM99	Q8N816	258 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	BMPER	Q8N8U9	685 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4A16	Q8NH70	328 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	THAP6	Q8TBB0	222 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	GIPC3	Q8TF64	312 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	PROX1	Q92786	737 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC39	Q96DD0	335 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	COQ2	Q96H96	371 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	C4orf36	Q96KX1	117 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM81B	Q96LP2	452 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	CHP1	Q99653	195 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957		Q9H8V8	135 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF14	Q9UBS8	474 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AKAP13-223	ENST00000560957	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCC4	O15439	1325 aa		2.59	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2M5	A3KFT3	312 aa		2.58	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PRR32	B1ATL7	298 aa		2.58	□□□□□ -2

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